ChIP-Seq测序数据分析流程 * 1.数据预处理 数据文件 FastQ文件 mapping file 原始数据 FastQ文件 2.序列比对 初步结果 3.RNA-Seq数据分析 进一步的结果 4. GO analysis FastQC结果 一个可以接受的例子 * 序列比对 下载数据(人类基因组数据) wget ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ERR365/ERR365991/ERR...
转录组分析(RNA-Seq)转录组分析(RNA-Seq)转录组分析(RNA-Seq)RNA-Seq的技术背景RNA-Seq的应用领域RNA-Seq面临的挑战及发展前景观察“胸廓”上下径的变化和“肺”的变化。问题:当“膈”运动时,“胸廓”的上下径和“肺”有什么变化?通过演示,引导学生分析讨论并归纳出膈肌的收缩和舒张引起胸廓上下径的变化。通过...
RNA-Seq(RNAsequencing)，即RNA测序又称转录组测序，就是把mRNA，smallRNA和non-codingRNA（ncRNA）全部或者其中一些用高通量测序技术进行测序分析的技术。3 转录组的含义：•转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA)。•转录组...
一、RNA-seq技术简介 1.诞生于20世纪70年代的Sanger法是最早被广泛应用的DNA测序技术，也是完成人类基因组计划的基础。2.2005年以来，以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代测序技术相继诞生，又称作深度测序技术。3.把高通量测序技术应用到由RNA逆转录生成的cDNA上，从而...
RNA测序数据分析;RNA data analysis;目录;RNA-seq简述;;;目录;RNA-seq常规分析;;;RNA-seq常规分析;;;RNA-seq常规分析;;;目录;RNA-seq高级分析;;;RNA-seq高级分析;;;RNA-seq高级分析;;;目录;;;RNA-seq问题;RNA-seq问题 下载文档 收藏 分享 赏 0您可能关注的文档重症病人的气道管理技术.ppt 派力迪VOCs与...
RNA-seq理论基础 RNA-seq通过测定稳定状态下的RNA样品的序列来对RNA样品进行研究,从而避免了许多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR就需要背景知识。而且RNA-seq还可以触及以前无法研究的领域,比… oriRNA RNA-RNA相互作用技术:MARIO 朝闻夕作发表于生物技术大... 第一章 RNA-seq入门 立源发表于关于RNA...
RNA-Seq的技术背景 RNA-Seq又称转录组高通量测序（transcriptomesequencing）或称为全转录组鸟枪法测序（WholeTranscriptomShotgunSequencingWTSS）原则上,所有的高通量测序技术都能进行RNA测序。自2019年以来,以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代测序技术相继诞生,之后Helicos...
一、RNA-seq技术简介 RNA-Seq(RNAsequencing)，即RNA测序又称转录组测序，就是把mRNA，smallRNA和non-codingRNA（ncRNA）全部或者其中一些用高通量测序技术进行测序分析的技术。ppt课件 6 转录组的含义：•转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA(non-...
1、单细胞 RNA-seq 分析Jie Li 下机数据的处理(10X为例) 单细胞分析(实操)Cellranger 简介 cell ranger是10X genomics公司提供的,专门用于分析10X 单细胞转录组数据的pipeline,包含了原始数据拆分,构建索引,表达定量,合并数据,聚类分析等多个功能。 直接从官网下载最新版的软件即可,网址如下:https:/ 安装Step1. ...
初步结果4.GOanalysis 进一步的结果 ChIP-SeqRNA-SeqChIA-PET。。。3 Expressedtranscriptsdetection Microarrays ExpressionExonarray...Sequence-based cDNAESTSAGE-serialanalysisofgeneexpression(3’)CAGE-capanalysisofgeneexpression(5’)MPSS-massivelyparallelsignaturesequencing RNA-seq=RNAsequencing 4 RNA-Seq •...