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DNA片段化比较常见的方式有超声打断和酶切打断。超声打断的步骤相对较复杂且费时(有空再介绍了) Tn5工作过程.png 在这个步骤中,smart-seq2中采用经过处理的Tn5转座酶衍生物(故名思意,转座酶是一种能够将识别DNA片段(转座子)两端的特异序列,将DNA片段(转座子)从原来的位点脱离或拷贝出来,再插入新的DNA靶位点中...
关于RNA-seq的简单介绍 RNA-seq是一款可用于研究和/或定量两个或多个条件下基因表达的实验技术。 众所周知,基因可以给蛋白质的合成提供指导,而蛋白质会在细胞中发挥一定的作用。尽管所有的细胞都包含… 阅读全文 登录知乎,您可以享受以下权益: 更懂你的优质内容 ...
1. 基因表达分析:RNA-seq可以计算基因的表达量,通过比较不同样本之间的表达量差异,可以发现差异表达基因,从而研究基因调控与疾病发生的关系。 2. 剪接异构体分析:RNA-seq可以揭示转录本的剪接异构体,即同一基因在不同组织或发育阶段中产生的不同转录本,有助于理解基因功能的多样性。 3. RNA编辑分析:RNA-seq可以...
转录组RNA-seq建库测序流程 生信狗的修炼秘籍 华中农业大学 生物信息学硕士 一、实验流程 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2. RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用… ...
RNA-Seq数据,在这里指的是基于NGS测序技术,在转录组水平对样本中基因表达进行定量,得到的counts数据,比如HTseq,hisat2,RSEM等上游定量分析软件得到的counts矩阵。 得到样本基因表达数据后,我们通常会对不同样本分组,然后进行差异表达分析,将基因表达变化与表型联系起来,解释与表型...
RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学研究相互补充...
RNA-Seq定量分析介绍