RNA-seq可以用于发现新的转录本,新的剪接形式,新的基因,以及新的非编码RNA。 4.可变剪接分析: RNA-seq可以用于研究可变剪接,这是一种调控基因表达的重要机制,可以产生多种不同的蛋白质异构体。 5.生物标志物发现: 在疾病研究中,RNA-seq可以用于寻找潜在的生物标志物,这些标志物可以用于疾病的早期诊断,预后评估,...
RNA-seq,即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA,small RNA,non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今, RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析,与标准RNA-seq 类似,...
- 适用范围广:可以用于基因表达定量、基因剪接分析、突变检测等。 RNA-Seq技术已经广泛应用于生物学研究,包括临床和基础研究。通过RNA-Seq技术,研究人员可以了解基因表达的模式,包括哪些基因被激活或抑制,以及它们的表达水平如何变化。此外,RNA-Seq技术还可以用于研究基因的可变剪接、转录本的多样性等。本文仅代表作者观...
RNA-seq数据旳基本处理 1.序列定位算法 （1）空位种子索引法：首先将读段切分，并选用其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再经过查找索引、延展匹配来实现读段定位，经过轮换种子考虑允许出现错配旳多种可能旳位置组合（Maq）。（2）Burrows-Wheeler转换技术：经过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再...
RNA - seq就是对转录组进行测序分析的技术。那什么是转录组呢?简单说就是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。这就像是一个细胞在某个时刻的“语言集”,RNA - seq就是要解读这个“语言集”的工具。 从原理上讲,RNA -seq的第一步就是提取RNA。这个过程就像是从细胞这个“小世界”里把“语...
RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性，转录组学有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组的表达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用；3）与蛋白组学...
单细胞 RNA-seq(Single-cell RNA sequencing)是一种高通量测序技术,可以对单个细胞中的RNA进行全面的测序和分析,以获得每个细胞的全基因组表达谱。这种技术可以帮助我们了解细胞在基因表达水平上的差异,从而揭示细胞的多样性和功能。它的出现极大地推动了生物学研究的发展,为我们深入了解细胞的多样性、功能和发育提供了...