RNA-seq是一款可用于研究和/或定量两个或多个条件下基因表达的实验技术。 众所周知,基因可以给蛋白质的合成提供指导,而蛋白质会在细胞中发挥一定的作用。尽管所有的细胞都包含相同的DNA序列,肌肉细胞同神经细胞以及其他类型的细胞还是不同的,原因在于在这些细胞中被开放(turned on)的基因不同,产生的RNA和蛋白质也...
应2022年发表在Briefings in Bioinformatics的综述文章“Bibliometric review of ATAC-Seq and its application in gene expression”显示,自2013年至2021年,使用ATAC-seq技术发表的文章数量呈指数级增长,并且ATAC-seq与ChIP-seq/RNA-seq联合的研究也在稳步增加。此外,整合近两年的ATAC-seq应用数据显示,ATAC-seq耦合Hi-...
将流式细胞术作为免疫组化、WES 和 RNAseq 之前的第一个诊断性检查,可使所有 T-NHL 和 B-NHL 患者在 3 个工作日后开始治疗(如有需要)。此外,RNAseq和WES分析提供重要的分子变异信息,有助于做出准确的诊断。基于这一经验,提出了一种流程,如图 4 所示。这缩短了诊断时间,能够在有临床指征时快速开始治疗。...
2、-mail: 网络出版时间: 2011-7-28 17:21:30 URL: DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.01191 转录组研究新技术:RNA-Seq 及其应用 祁云霞1,2, 刘永斌2, 荣威恒2 1. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018; 2. 内蒙古自治区农牧业科学院, 呼和浩特 010031 摘要: 转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段...
科研团队创建了RNA原位构象测序技术“RIC-seq”。以该技术为主要手段,他们首次全景式解析了非编码RNA的二级结构、作用靶标和高级结构。该原创技术获得了国家发明专利,并已成功进行成果转化。在此基础上,该团队还发展了capture RIC-seq、vRIC...
Direct RNA sequencing(dRNA-seq):直接测序RNA而非cDNA的测序技术,通常用于测序全长或近全长的mRNA 。 Multi-mapped reads多重比对的reads:从转录组同源区域测序得到的reads,不能精确确认其转录本或基因组的来源。 Synthetic long reads合成long reads:通过组装多个短读长得到长读长的方法。
简单回顾测序技术的发展,从桑格尔发明双脱氧末端终止法(一代测序)到人类基因组计划历时13年耗费30亿美元,测序一直很贵,直到高通量的边合成边测序技术(二代测序)出现。随着测序价格的不断下降,2009年开发出了第一个单细胞转录组测序方法(汤富酬)。 经过8年多时间的发展,如今不同的scRNA-seq流程有了大量改进,它们一...
比如针对很多癌症样本,经常会出现一些很重要的高表达gene发生普遍的上调或者下调,从而导致整个样本不符合RNA-Seq正常定量的基本假设。那么这个时候,如果继续使用常规的寻找差异表达的方法来对基因进行定量以及分析,就可能会出现偏差,这时候就需要通过参照物进行矫正。
近年来出现的RNA‑seq建库试剂盒主要侧重于RNA链特异性研究,文库建库过程需要提取总RNA并富集mRNA,通过逆转录合成第一链cDNA,使用dUTP合成第二链cDNA,随后进行双链cDNA的末端补平、加腺嘌呤A碱基再进行接头连接,消化含尿嘧啶U碱基的cDNA后通过PCR扩增完成建库。 [0003]其具体的建库过程如下: [0004](1)添加dUTP...
快速轻松地验证复杂 RNA-Seq 数据 快速且高性价比地完成大量研究7 使用免费的转录组分析控制台 (TAC) 软件在数分钟内分析数据 缩短周转时间。在几分钟内获得数据。 使用简单免费的 TAC 软件,您可以: 识别基因、外显子和选择性剪接事件 探索miRNA 和靶基因网络之间的表达变化 使用外显子和连接...