Pull down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用关系,从体外转录或翻译体系中检测出蛋白相互作用关系。RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA pull down是使用体外转录法标记生物素RNA探针,然...
信号明显增强,则表明RNA与相应蛋白结合;否则,表明此蛋白可能与RNA无关。 3. PCR 利用PCR技术可以进行RNA的定量分析。通过比较实验组和对照组RNA的含量,了解RNA结合蛋白质是否影响了RNA的表达水平,从而检测该RNA是 否是一个重要的结合目标。 需要注意的是,在进行RNA pull-down实验时,需要进行对照实验以验证实验结果...
通过扩大性分析,可以在pull-down实验中发现大量潜在的RNA结合蛋白质或RNA分子。最近,通过定向密集了解并且对全基因组探针进行逐一筛 查配对拉下实验证明神经退行性疾病(如帕金森氏症和肌萎缩侧索硬化)与多个mRNAs具有相同的RNA结合伴侣。 总之,RNA pull-down实验结果分析需要根据检测模块及有关的科学问题,选取不同的方...
8、将吸附柱CB2放入一个新的离心管中,向吸附膜中间位置滴加30μl洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12,000rpm离心1min,收集DNA溶液。 5实验结果 l正义链和反义链PCR扩增琼脂糖凝胶图 Marker:DL2000 Sense:正义链产物 Antisense:反义链产物 二.RNA-RNApull down实验 1实验目的:通过RNA-RNA pull down实验,在细胞中获...
结果说明:通过RPd-WB验证目的RNA和候选蛋白互作。 本次实验的目的是使用RNA-Pull down-MS或者RNA-Pull down-WB的方法,通过体外转录法标记生物素RNA探针,在目的细胞中通过目的探针把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化并对结合在复合物上的蛋白进行MS或WB分析,寻找目的RNA的靶标蛋白,或在不同遗传背景或处理...
(2)结果 (3)结果描述 结果描述也比较简单,只要描述清楚PAARH组可富集各种miRNA即可。 三、pulldown实验 1、实验原理 Pull down技术的基本原理是将一种蛋白质A固定于某种基质上,在进行细胞抽提时,可与蛋白A相互作用的配体蛋白B被吸附。被吸附的蛋白B可以通过改变洗脱液或洗脱条件而回收下来。通过pull down技术可以...
案例一题目:The STAT3-Binding Long Noncoding RNA lnc-DC Controls Human Dendritic Cell Differentiation小结:RNA pull-down设置实验组及反义链对照组,银染找出差异条带进行胶条质谱鉴定,分析结果筛选得到STAT3蛋白,进一步通过RIP-qPCR反向验证,证实STAT3蛋白可以与lnc-DC结合。Lnc-DC pull-down 银染检测及RIP验证...
DNA pull-down实验首先针对靶标区域设计特异性DNA探针,探针经过脱硫生物素标记,跟偶联在磁珠上的链霉亲和素结合;细胞核提取物与磁珠-DNA探针孵育,作用蛋白质分子可以和DNA探针特异性结合;纯化出与靶DNA片段结合的蛋白复合体,经过洗涤可...