RIP、RNA pull-down和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白...
除RIP和RNA pull Down以外，凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA)，也称为凝胶阻滞实验或DNA结合实验，是一种广泛应用于分子生物学的研究技术，也可以用于研究蛋白质（尤其是转录因子）与DNA或RNA之间的相互作用。基本原理 EMSA的基本原理是利用凝胶电泳技术来观察蛋白质与DNA或RNA形成...
随后利用RNA Pull-Down技术鉴定与ELENA1结合的中介体亚基,结果显示MED19a与MED26b均能在体外与ELENA1 RNA结合,同时利用elf18处理MED19a/MED26b敲除株,发现只有MED19a敲除株中PR1表达情况显示出与ELENA1敲除株系相似的趋势。进一步利用GFP标记法、TriFC、RIP实验证明中介体亚基MED19a与ELENA1在体内也存在相互作用。以上...
简而言之，RIP是在已知蛋白的情况下，利用目标蛋白的抗体，把蛋白和RNA复合物一起沉淀下来，然后经过分离纯化获得结合在复合物上的RNA，最后通过定量RT-PCR或高通量测序（RIP-Seq）方法来鉴定，这里的RNA可以是mRNA，也可以是非编码RNA，如circRNA，lncRNA，miRNA等。RIP-seq实验流程 RNA pull-down RNA pull-down是...
随后利用RNA Pull-Down技术鉴定与ELENA1结合的中介体亚基,结果显示MED19a与MED26b均能在体外与ELENA1 RNA结合,同时利用elf18处理MED19a/MED26b敲除株,发现只有MED19a敲除株中PR1表达情况显示出与ELENA1敲除株系相似的趋势。进一步利用GFP标记法、TriFC、RIP实验证明中介体亚基MED19a与ELENA1在体内也存在相互作用。以上...
RNA Pull-down和RNA免疫沉淀（RNA Immunoprecipitation， RIP）是研究RNA和蛋白互作的主流技术。RNA Pull-down更倾向于通过目标RNA（已知的RNA）去找到相互作用的未知蛋白，而RIP技术则更多应用于通过目标蛋白（已知蛋白）去找到相互作用的未知RNA。技术原理 RNA Pull-down用于研究RNA与蛋白质之间的相互作用。这项技术在...
(三)云序客户利用RIP和RNApull down技术发表环状RNA机制文章解析 云序客户文章1:探究环状RNA的海绵机制 发表期刊:Cancer Gene Therapy 影响因子:4.681 实验方法:RIP-PCR、RNA pull down-PCR 实验对象:前列腺癌细胞 文献网址:https://sci-hub.shop/10.1038/s41417-019-0085-y ...
近年来,以长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)为中心连同miRNA被发现具有广泛的生物学功能,逐渐成为生物医学领域的研究热点,而RIP-seq与RNA pull down是非编码RNA与蛋白研究中最常用到的两种分子互作技术。小编将逐一对这两种技术进行介绍。
RNA Pull Down和RIP的技术应用:ELF18诱导的lncRNA ELENA1与MED19a互作增强拟南芥免疫反应 植物和动物在自然环境中都面临着被各种微生物感染的风险。与动物一样,植物也演化出了一套模式识别受体(PRRs),这些受体能识别整个微生物病原体类别的分子特征,进而启动先天免疫反应。本文鉴定了拟南芥中一种长非编码RNA(lncRNA...
近年来,以长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)为中心连同miRNA被发现具有广泛的生物学功能,逐渐成为生物医学领域的研究热点,而RIP-seq与RNA pull down是非编码RNA与蛋白研究中最常用到的两种分子互作技术。小编将逐一对这两种技术进行介绍。