1. RNA pull-down的原理 RNApull-down是研究细胞内RNA与蛋⽩/RNA结合情况的技术。先将RNA进⾏标记 (如⽣物素标记),再与细胞裂解液共同孵育,从⽽形成RNA-RNA/蛋⽩质复合物,进 ⽽检测与之结合的RNA或蛋⽩质。复合物洗脱后,通过荧光定量PCR(RNA pull down- QPCR)或⾼通量测序(RNApull down-seq...
1. RNA pull-down技术原理 RNA pull down技术是一个非常经典的以RNA为研究对象,寻求互作蛋白的技术。其技术原理是,体外转录或化学合成获取目标RNA,对RNA末端进行生物素标记制备探针,而后将标记生物素的RNA与蛋白裂解液进行孵育,获取探针-蛋白复合物,而后利用链霉亲和素磁珠结合探针-蛋白复合物,洗脱非特异性蛋白后,we...
一、基本原理 RNA Pull down技术利用带标签的RNA探针与目标蛋白质进行体外或体内结合,然后通过亲和分离或免疫共沉淀等方法将结合的复合物分离出来,最后对分离出来的复合物进行检测和分析。这种技术可以快速、有效地筛选和鉴定与特定RNA结合的蛋白质,同时也可以检测和分析RNA的结构和功能。二、实验步骤 设计并合成带标...
除RIP和RNA pull Down以外,凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA),也称为凝胶阻滞实验或DNA结合实验,是一种广泛应用于分子生物学的研究技术,也可以用于研究蛋白质(尤其是转录因子)与DNA或RNA之间的相互作用。基本原理 EMSA的基本原理是利用凝胶电泳技术来观察蛋白质与DNA或RNA形成...
一、RNA pull-down的原理 RNA pull-down技术的原理基于RNA的序列与蛋白质的互补性。在实验中,我们通常使用目标RNA序列(也称为“诱饵RNA”)的互补RNA链或合成肽核苷酸。通过这种互补性,诱饵RNA能够特异性地结合目标蛋白质。 二、RNApull-down的步骤 1.设计和合成诱饵RNA 在RNA pull-down实验中,首先需要设计和合成...
RNA pull-down的实验原理是什么?为什么要这么做? RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过WB实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。 蛋白质与RNA的相互作用是...
RNA pull-down除了可以研究RNA与蛋白互作,也可以研究RNA与RNA互作,可通过探针法来研究。实验常见问题 1 RNA结合蛋白的亲和力不够的原因?可能的原因:1)结合缓冲环境没有优化;2)裂解不完全;3)磁珠用量不足;4) RNA探针用量不足。解决方案:1)优化孵育时间、温度、盐浓度等条件;2)增加裂解液和蛋白上样量的...
技术原理 RNA Pull-down用于研究RNA与蛋白质之间的相互作用。这项技术在细胞裂解液中使用生物素标记的RNA探针来捕获与其结合的蛋白质。随后,通过链霉亲和素偶联的磁珠将这些RNA-蛋白质复合物分离出来,从而实现对结合蛋白的富集。之后可以通过质谱分析、Western blot等方法鉴定所富集的蛋白质。图2 RNA Pull-down实验...
1. 实验原理简述:体外RNA pull down技术是一种用于研究蛋白质与RNA相互作用的方法。该方法通过将荧光标记的RNA分子与表达载体结合,构建表达荧光标记的RNA分子与目标蛋白融合的重组载体,然后将重组载体转染至细胞中,使其在细胞内表达荧光标记的蛋白。通过进一步的处理和分析,可以鉴定出荧光标记的蛋白是否与荧光标记的RNA...