RIP、RNA pull-down和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白...
发生m6A修饰的mRNA想要行使特定的生物学功能,需要一种特定的RNA结合蛋白——甲基化阅读蛋白,也叫reader。RNA pull-down实验已经鉴定了多种阅读蛋白,包括YTH结构域的蛋白、核不均一核糖蛋白(hnRNP)以及真核起始因子(eIF)等。这些阅读蛋白的功能主要包括特异性结合m6A甲基化区域,削弱与RNA结合蛋白同源结合以及改变RNA二级...
RNA-RNA pull-down是检测RNA与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA-RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆提取液孵育,形成RNA-RNA复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过qRT-PCR实验检测特定的RNA是否与靶标RNA相互作用。缺点:...
软件名称RNA pull down质谱结果分析软件 软件简称-版本号V1.0 登记号2024SR1085538分类号- 著作权人上海佐润基因科技有限公司首次发表日期2024-06-01 登记日期2024-07-30 该公司其他软件著作权 序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号 12024-07-30荧光定量PCR监控软件-2024SR1086468V1.0 ...
RNA pull-down实验已经鉴定了多种阅读蛋白,包括YTH结构域的蛋白、核不均一核糖蛋白(hnRNP)以及真核起始因子(eIF)等。YTHDF1-3主要在胞浆中特异性识别m6A修饰的mRNA,而YTHDC1-2的作用部位主要在细胞核内。eIF3蛋白能够与RNA 5’端UTR上发生m6A修饰的碱基相结合,从而促进mRNA的翻译。 m6A甲基化检测方法有哪些?
通过 RNA pull-down 和 RIP-seq 实验验证了 METTL14 与推测靶点的特异性结合。此外,作者还进行了表型补救实验和 MeRIP-seq 来揭示其机制。临床上,METTL14 缺失与 CRC 患者预后不良相关。在功能上,下调 METTL14 可以显著增强 CRC 细胞的体外增殖和侵袭能力,在体内促进肿瘤的发生和转移。机制上,RNA-seq 和 Me-...
云序生物是业内少数的既做前端高通量测序筛选,同时实现一站式解决功能机制的科研服务公司。在各RNA分子研究火热的现阶段,更多科研工作者想要在通过高通量筛选到目的基因后,解决RNA的分子机制问题,云序提供的RIP和RNA pull down技术正好解决分子机制的核心技术难点。
RNApull-down实验已经鉴定了多种阅读蛋白，包括YTH结构域的蛋白、核不均一核糖蛋白（hnRNP）以及真核起始因子（eIF）等。这些阅读蛋白的功能主要包括特异性结合m6A甲基化区域，削弱与RNA结合蛋白同源结合以及改变RNA二级结构从而改变蛋白与RNA的互作。具有YTH结构域的蛋白包括YTHDC1-2和YTHDF1-3等。YTHDF1-3主要在胞...
研究确定了长非编码 RNA(lncRNA)PGM5-AS1 在 EMT 和骨肉瘤进展中的分子机制;基于微阵列的分析用于筛选骨肉瘤相关的差异表达的 lncRNA;测定骨肉瘤组织和细胞中 PGM5-AS1 以及 microRNA-140-5p(miR-140-5p)和原纤维蛋白 -1(FBN1)的水平;荧光素报告系统确认结合片段,RNA pull-down 实验和 RNA 蛋白免疫沉淀...