RIP、RNA pull-down和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein ImmunoprecipitationAssay,RNA 结合蛋白免...
RNA pull-down实验已经鉴定了多种阅读蛋白,包括YTH结构域的蛋白、核不均一核糖蛋白(hnRNP)以及真核起始因子(eIF)等。这些阅读蛋白的功能主要包括特异性结合m6A甲基化区域,削弱与RNA结合蛋白同源结合以及改变RNA二级结构从而改变蛋白与RNA的互作。 具有YTH结构域的蛋白包括YTHDC1-2和YTHDF1-3等。YTHDF1-3主要在胞...
软件名称RNApulldown实验技术服务平台 软件简称-版本号V1.0 登记号2021SR0983254分类号- 著作权人上海典西生物科技有限公司首次发表日期2021-04-02 登记日期2021-07-05 该公司其他软件著作权 序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号 12024-11-26CHIRP-seq基因检测服务管理平台-2024SR1896485V1.0 ...
RIP-seq,全称 RNA Immunoprecipitation Sequencing,该技术从一种已知的蛋白质出发,使用针对该蛋白的特异性抗体将目标蛋白以及与其结合的 RNA 复合物沉淀下来, 进而对富集到的 RNA 进行分离和建库测序,从而揭示 蛋白质-RNA 之间的结合关系。 RIP-seq 拥有广泛的应用场景,例如:通过针对 AGO2 蛋白的 RIP-seq,可以获取...
RNA-RNA pull-down是检测RNA与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA-RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆提取液孵育,形成RNA-RNA复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过qRT-PCR实验检测特定的RNA是否与靶标RNA相互作用。缺点:...
通过 RNA pull-down 和 RIP-seq 实验验证了 METTL14 与推测靶点的特异性结合。此外,作者还进行了表型补救实验和 MeRIP-seq 来揭示其机制。临床上,METTL14 缺失与 CRC 患者预后不良相关。在功能上,下调 METTL14 可以显著增强 CRC 细胞的体外增殖和侵袭能力,在体内促进肿瘤的发生和转移。机制上,RNA-seq 和 Me-...
研究确定了长非编码 RNA(lncRNA)PGM5-AS1 在 EMT 和骨肉瘤进展中的分子机制;基于微阵列的分析用于筛选骨肉瘤相关的差异表达的 lncRNA;测定骨肉瘤组织和细胞中 PGM5-AS1 以及 microRNA-140-5p(miR-140-5p)和原纤维蛋白 -1(FBN1)的水平;荧光素报告系统确认结合片段,RNA pull-down 实验和 RNA 蛋白免疫沉淀...
pull-down原理图【54】 凝胶阻滞迁移实验(ElectrophoreticMobility Shift Assay,EMSA)是一种研究蛋白 和DNA,蛋白和RNA相互结合的技术,可用于定性和定量分析。最初用于研究蛋 白和DNA的结合,目前已用于蛋白与RNA结合或与特定的RNA序列相互作 用。早前也有很多文献报道该技术,目前主要采用的方法是由Garnerl551,Friedl56】...
RNApull-down实验已经鉴定了多种阅读蛋白，包括YTH结构域的蛋白、核不均一核糖蛋白（hnRNP）以及真核起始因子（eIF）等。这些阅读蛋白的功能主要包括特异性结合m6A甲基化区域，削弱与RNA结合蛋白同源结合以及改变RNA二级结构从而改变蛋白与RNA的互作。具有YTH结构域的蛋白包括YTHDC1-2和YTHDF1-3等。YTHDF1-3主要在胞...