近日,来自UIUC的Kevin Van Bortle研究团队在Molecular Cell上发表了题为Evidence of RNA polymerase III recruitment and transcription at protein-coding gene promoters的文章,采用综合的基因组方法,研究了RNA Pol III在蛋白质编码基因启动子...
其中,RNA聚合酶III(Pol III)不仅是细胞核内转录tRNA、5S rRNA、SINEs等短基因的核心机器[1],还参与DNA双链断裂的同源重组修复[2],同时在细胞质中通过转录富含A-T的DNA病毒模板来触发天然免疫[3, 4]。与其他两种RNA聚合酶主要定位于细胞核内发挥功能不同,Pol III在细胞质中作为病毒DNA的感知器同样具有转录活性...
近日,英国剑桥大学Ritwick Sawarkar研究组与Sergio Leone(第一作者)合作在Molecular Cell上发表了文章HSP70 binds to specific non-coding RNA and regulates human RNA polymerase III,发现伴侣蛋白热休克蛋白HSP70结合由RNA聚合酶Pol III转录的非编码RNA,调节RNA Pol III的转录。 分子伴侣比如HSP70与HSP90在蛋白质稳定...
多数的siRNA表达载体依赖RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol III启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表达更多的小分子RNA,而且它是通过添加一串(3...
🔍今日文献聚焦:Pol3Base数据库,一个全面解析RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA)的平台。📚该数据库不仅涵盖了P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络,还提供了一个强大的资源来解码这些非编码RNA的功能。🔍通过Pol3Base,研究人员可以更深入地了解非编码RNA在生物体中的复杂作用...
总的来说,作者们的工作发现分子伴侣蛋白HSP70与非编码RNA直接相互作用,这些非编码RNA主要由RNA Pol III所转录,HSP70与RNA Pol III共同结合在这些非编码RNA基因组的转录起始位点,HSP70的存在则会调节RNA Pol III的转录(图2)。这一工作为分子伴侣蛋白对核苷酸...
实现组织特异性干扰的辅助工具—miR30结构 RNA干扰 (RNAi)是一种进化上保守的转录后基因调控机制,它是由双链RNA(dsRNA)诱发同源mRNA高效特异性降解从而抑制基因表达的现象,是研究基因功能常用的手段之一。用于诱导持续的RNAi的手段,是用pol III型启动子表达shRNA,常用的pol III型启动子有U6和H1,由于构建序列...
真核生物有三种非常保守的RNA聚合酶,Pol I、Pol II和Pol III,它们分别产生rRNA、mRNA和tRNA等不同种类的RNA。而在植物中,还存在两种额外的RNA聚合酶,Pol IV和Pol V。Pol IV和Pol V转录本在RNA介导的DNA甲基化(RdDM)通路中发挥关键作用。其中,Pol IV转录本可被加工成24-nt siRNA,siRNA与AGO4蛋白结合...
这三种RNA聚合酶都产生lncRNA,其中Pol I和Pol III专门用于产生lncRNA,而Pol II尽管在mRNA生物发生中起主要作用,但也产生一系列的lncRNA。值得注意的是,植物还使用另外两种酶,Pol IV和Pol V来产生lncRNA,这些lncRNA对于识别和沉默转座因子(TEs)至关重要。核RNA聚合酶由12到17个亚基的特定组合组成,包括最...
1、RNA聚合酶III复合基因的突变 Pol III酶负责转录tRNA以及其他几种非编码RNA,包括5S核糖体RNA、U6小核RNA、7SLRNA、7SKRNA 和核糖核酸酶P(RNase P)RNA。Pol III(也称为POLR3)的17个亚基中,有9个会发生各种遗传突变,这些突变已经被与多种神经退行性疾病关联起来(Fig 2a)。编码Pol III亚基的基因中的六个突...