[7]. Wang, X., Q. Li, S. He, et al. LncRNA FENDRR with m6A RNA methylation regulates hypoxia-induced pulmonary artery endothelial cell pyroptosis by mediating DRP1 DNA methylation. Mol Med, 2022, 28(1): 126.
参考文献: [1] Zaccara, Sara et al. “Reading, writing and erasing mRNA methylation.” Nature reviews. Molecular cell biology vol. 20,10 (2019): 608-624. doi:10.1038/s41580-019-0168-5 [2] Zhou, Yujia et al. “Principles of RNA methylation and their implications for biology and medicin...
表观遗传学,包括组蛋白共价修饰(covalenthistone modification)、DNA 甲基化修饰(DNAmethylation)、RNA 甲基化修饰(RNA methylation)、基因组印记(genomic imprinting)、基因沉默(genesilencing)、RNA 编辑(RNA editing)及非编码RNA(noncoding RNA)等,是指在核苷酸序列不发生改变的情况下,生物表型或基因表达发生了稳定的可...
【答案】:首先在植物中发现的一种RNA指导的沉默机制。类似于:RNA干扰(RNAi),RdI)M也需要21~26nt的双链RNA片段。与短双链RNA同源的DNA序列被甲基化,从而使基因沉默。
lncRNA是一类长度超过200nt的长链非编码RNA的统称,绝大多数不具备蛋白编码能力。lncRNA通过多种机制参与表观遗传修饰,进而调控基因表达和细胞命运,主要包括直接作用于染色质、调控DNA甲基化、组蛋白修饰、影响染色质重塑复合物以及与其它非编码RNA互作调控。1. 调控染色质结构状态:一方面lncRNA可以直接作用于染色质,...
5. Legrand, C. et al. Statistically robust methylation calling for whole-transcriptome bisulfite sequencing reveals distinct methylation patterns for mouse RNAs.Genome Res27, 1589–1596 (2017). 6. Hu, L., Liu, S., Peng, Y. et al. m6A RNA modifications are measured at single-base resolution...
那么如何检测 RNA 的甲基化水平呢? EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(比色法)是一组优化的、完整的的试剂组合,可以通过比色的方法定量 RNA 中 N6-甲基腺嘌呤(m6A)。它可以直接检测哺乳动物,植物,真菌细菌和病毒的总 RNA 样本的 m6A 的甲基化程度。
1. DNA甲基化和相关功能变化的泛癌图谱 为了构建癌症甲基化和相关功能变化的图谱,研究人员从CPTAC收集了687例具有可用的DNA甲基化谱(Infinium EPIC array)、基因表达(RNA-seq)和蛋白质丰度(mass spectrometry)的人类肿瘤,包括7种癌症类型。该队列由107例肾透明细胞癌(ccRCC)、94例胶质母细胞瘤(GBM)、104例头颈部鳞...
Site-specific RNA methylation by a methyltransferase ribozyme A methyltransferase ribozyme, along with the small-molecule cofactorO6-methylguanine, is shown to catalyse the site-specific installation of 1-methyladenosine in various RNAs, providing insights into the catalytic abilities of RNA. ...
在染色质层面通过DNA甲基化和组蛋白修饰,以及在转录后层面通过RNA编辑和RNA干扰抑制HERVs活性,是目前研究得最深入的HERVs抑制机制【2】。然而,这些机制并不适用于所有细胞类型和发育阶段。 近日,来自法国巴黎居里研究所的Deborah Bourc’his和Tomasz Chelmicki团队在Nature杂志上合作发表了一篇题为m6A RNA methylation ...