通过这些方法,我们可以提高RNA FISH实验的准确性。探针浓度过高或杂交时间过长,都可能导致高背景荧光。为了解决这一问题,我们可以尝试使用不同梯度的探针浓度,并适当缩短杂交的时间。此外,在探针杂交之前,增加一个预杂交步骤也是有帮助的,即用杂交缓冲液在正式杂交条件下处理一段时间。另外,如果洗涤不充分,可
核质分离的qRT-PCR检测结果显示lncRNA PEG10主要定位于细胞质中。 总结 FISH与核质分离实验有相同的功能,都可以观察lncRNA的亚细胞定位,即lncRNA定位于胞浆还是胞核;FISH的图片应标注清楚每个图片中荧光所表示的分子,分组情况也要表明图注中应该包含细胞系的名称和处理方法,每种颜色的所代表的分子,这里标注的方式比较...
在寒冷暴露下,作者通过单分子RNA FISH显像技术分析“云”结构对FLC转录的影响机制。正如图3a所示,在植物正常暴露或寒冷暴露下,COOLAIR转录(绿色)和FLC(红色)转录显示相互排斥的关系,在单个基因座上正义转录和反义转录也呈现反相关,结果表明基因座上的转录在任何给定时间下都是单向的(图3b)。尽管FLC正义转录和反义转...
https://www.biosearchtech.com/support/education/stellaris-rna-fish/applications/lnc-rna-fish Stellaris RNA FISH单分子荧光原位杂交的优势 传统的原位杂交技术除了灵敏度受限,还不能做多重,无法定量,操作上也比较耗时和复杂,Stellaris RNA FISH单分子荧光原位杂交却很好地解决了这些问题。 灵敏度高:可检测单细胞、...
RNAseq和FISH的结果总结于表1和图1。总体而言,RNAseq识别了FISH鉴定的1/7 MYC(14%)、3/8 BCL2(38%)和4/8 BCL6(50%)易位(图1)。在RNAseq检测到的2例MYC重排中,伴侣基因均为IGH,其中一例先前FISH检测到,另一例由于IHC显示MYC蛋白染色水平较低,先前未进行FISH检测。后一例患者后续进行了MYC 断裂分离...
(G)使用背靠背引物在cDNA或gDNA中扩增circ_0006896的琼脂糖凝胶电泳结果 (H)RNase R处理后circ_0006896和KIAA1429的mRNA表达。 (I)RNA FISH分析显示circ_0006896在AML细胞中的定位 2.circ_0006896调控外泌体诱导的AML发展 体外研究表明,circ_0006896的敲除抑制了AML增殖,增加了细胞凋亡,并增强了AML细胞对IDA的药物...
完成实验。实验完成后,进行数据处理,收集和分析实验结果。RNA-FISH实验不仅能够揭示特定RNA分子在细胞或组织中的分布模式,而且对研究分子生物学、疾病机制、基因表达调控等具有重要意义。通过本文的引导,你不仅能够亲手完成RNA-FISH实验,更能够深刻理解这一技术在科研领域的应用价值。
研究结果 1. SNHG10和SCARNA13在肺转移灶和HCC组织中高表达,与HCC患者预后不良有关 为了鉴定参与HCC转移的ncRNA,研究人员利用RNA-seq比较异种移植的HCC细胞和亲本HCC细胞之间的表达谱,并进一步通过TCGA LIHC数据库分析以及交叉分析鉴定出24个lncRNAs和6个snoRNAs可能在HCC的肿瘤发生和转移中起关键作用。其中SNHG10和SC...
RNA单细胞单分子水平定位、定量分析; 测序后的基因表达结果验证; 多基因表达的定量、定位分析; 感染性RNA病毒检测等。 联系我们(010-57438396或xieyl@nwbiotec.com, heyy@nwbiotec.com)获取FISH-Flow Nature Protocol: FISH-Flow, a protocol for the concurrent detection of mRNA and protein in single cells ...