与复制相关的RNA-DNA杂合链最主要来源是滞后链复制,在此期间DNA聚合酶-α (Polα)-引物复合物每约200个核苷酸合成一个8-10个核苷酸长度的RNA引物。然而,这些杂合链在冈崎片段成熟过程中通常会被去除,此时RNA引物和由他们产生的DNA延伸被DNA Pol δ置换,并且由此产生的flaps被flaps内切酶1 (FEN1) 去除。基于RNA引...
与复制相关的RNA-DNA杂合片段最主要的来源是滞后链复制,其中DNA聚合酶α(Polα)-引物酶复合物大约每200个核苷酸合成一个8至10个核苷酸长的RNA引物。 然而,这些杂合片段在Okazaki片段(冈崎片段)成熟过程中通常会被移除,此时RNA引物和大部分由Polα合成的DNA延伸部分会被DNA Polδ移除,而由此产生的翻边结构则由翻边核...
之前的工作表明RNA:DNA杂合链会在S期积累在RTS1-RFB(复制叉屏障)的上游和下游【4】,且RNase H1和H2活性的缺乏会导致细胞对复制阻断剂和杂合链的积累敏感【5】,因此作者研究了RNase H1和H2在促进RFB复制恢复中的作用,发现在两者缺乏的...
之前的工作表明RNA:DNA杂合链会在S期积累在RTS1-RFB (复制叉屏障) 的上游和下游【4】,且RNase H1和H2活性的缺乏会导致细胞对复制阻断剂和杂合链的积累敏感【5】,因此作者研究了RNase H1和H2在促进RFB复制恢复中的作用,发现在两者缺乏的情况下,在停滞的复制叉处的杂合链会干扰新生链降解,进一步通过对RNase H1和...
R-loop是由转录的RNA链与打开的双链DNA其中一条模板链发生碱基互补配对,形成RNA-DNA杂合链,同时使未配对的另一条DNA链游离在外组成的三方结构 [1]。它们分布广泛,占哺乳动物基因组的 5% [2,3]。R-loop经常出现在基因组的启动子和转录终止位点, 影响R-loop形成的结构因素包括高度的GC偏倚(GC skew,在TSS下游...
清华大学孙前文实验室的最新研究发现RNA:DNA hybrids结构协助拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制,证实RNA:DNA hybrids在促进同源重组修复和叶绿体细胞器发育过程中的积极作用,揭示了RNase H1蛋白AtRNH1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在共同维持叶绿体基因组完整性过程中发挥着举足轻重的作用。
此外,复制蛋白A (Replication Protein A, RPA) 作为单链DNA结合蛋白,不仅可以提高RNase H1对 RNA 3′-5′方向的降解速率和持续性,同时通过帮助解旋杂合链激活其5′-3′的外切酶活性(图1),从而保证RNase H1对杂合双链的持续双向降解。这些发现揭示了RNase独特的酶活特性,提供了RPA促进RNase H1降解杂合链的分子...
RNA聚合酶II具有通向镁离子的中央通道。中央通道就是转录发生的地方。双链DNA进入中央通道,然后两条DNA链分开(图2B)。一条链在靠近酶中心的镁离子的地方弯折。就在这个被称为活性中心的位置,mRNA按照DNA链弯曲部分的模板进行合成。最后,DNA-mRNA杂合结构以相对于进入酶的DNA约90°的角度离开酶。
就是一条DNA单链和一条mRNA以碱基互补配对原则形成的杂合双链。比如说在DNA转录过程中形成的特殊结构,但是转录结束就会分开。