RNA-DNA杂合片段(RNA-DNA Hybrid)在转录、DNA复制和DNA修复过程中生成,并在这些过程中充当至关重要的中间体。当RNA-DNA杂合片段在双链DNA中稳定形成时,它们会移除一条DNA链,形成一种称为R-loop的三链结构。R-loop在基因组中普遍存在,并且在活跃基因区域富集。R-loop在调控基因表达和染色质结构方面发挥着重要作用...
这些发现表明,DSBs处RNA从头合成促进了RNA-DNA杂合链的形成。然而,在特定位点诱导DSBs后对RNA-DNA杂交链的全基因组图谱显示,杂交链水平的增加主要发生在转录活性区域,这表明预先存在的RNA转录物在损伤诱导的RNA-DNA杂交链形成中起主要作用。相应地,当由特定染色体位点的活性氧 (ROS) 诱导DSBs和单链断裂 (SSBs) 时,...
正如我们之前在图2B中看到的,当DNA在RNA聚合酶II内部移动时,需要弯折才能转录成mRNA。然而,正常情况下的DNA非常硬,不易弯曲。想要弯曲的话,它需要被分成单链——这种形式才完全灵活并且可以自由弯曲。这便是GTFs的用武之地:在GTFs找到DNA分子中基因的开端后,它们接着打开DNA,并将其弯折到RNA聚合酶II中转录的活...
就是一条DNA单链和一条mRNA以碱基互补配对原则形成的杂合双链。比如说在DNA转录过程中形成的特殊结构，但是转录结束就会分开。
清华大学孙前文实验室的最新研究发现RNA:DNA hybrids结构协助拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制,证实RNA:DNA hybrids在促进同源重组修复和叶绿体细胞器发育过程中的积极作用,揭示了RNase H1蛋白AtRNH1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在共同维持叶绿体基因组完整性过程中发挥着举足轻重的作用。
另一类是基于催化失活的RNase H1,此突变酶可特异性结合DNA-RNA杂合链但不行使RNA消化功能,然后再进行类似ChIP实验,代表性的技术是R-ChIP,由加州大学付向东老师团队开发(现已全职加入西湖大学)。 随着CUT&RUN和CUT&Tag逐步取代ChIP-seq之势,后续又有研究者利用MNase或Tn5酶代替ChIP过程对R-loop进行检测,分别开发出...
之前的工作表明RNA:DNA杂合链会在S期积累在RTS1-RFB(复制叉屏障)的上游和下游【4】,且RNase H1和H2活性的缺乏会导致细胞对复制阻断剂和杂合链的积累敏感【5】,因此作者研究了RNase H1和H2在促进RFB复制恢复中的作用,发现在两者缺乏的...
也就是DNA单链和RNA单链通过碱基互补原则配对形成的杂合双螺旋双链，只不过这种双螺旋并不是沃森克里克...
DNA上分子内G四链体的形成需要至少4段多聚鸟嘌呤序列,而DNA/RNA杂合G四链体的形成仅需要DNA非模板链上含有2段或以上多聚鸟嘌呤,因而这种杂合结构的发现极大的扩充了人们对G四链体形成能力的认识。中科院动物研究所端粒与衰老研究组进一步通过生物信息学的方法,对人和其他物种中具有杂合G四链体形成能力的DNA序列(...