并且在不同体外实验所用到的肝细胞系上的表达丰度也有诸多研究[38, 75, 76];siRNA 从内体的逃逸可以通过延时共聚焦荧光显微镜来可视化,只有极少部分 (1%~2%) 的siRNA 从内体中释放,并且逃逸过程是siRNA 药物发挥作用的限速步骤,但是逃逸...
在5°C下经过长时间的溶液内孵育后源自Eterna的设计(RLT-10和布加克曼的Lost_LD+fine tuning_mod_Deg-...
结果证明,该模型可以有效预测先兆子痫,灵敏度为75%,阳性预测值为32.3%,AUC(即ROC曲线下面积)为0.82(图5c)。将模型应用于测试阳性和阴性个体时,阳性人群在妊娠期间分娩更早(图5d),可正确识别出73%发生早产的孕妇。 图5. c. 先兆子痫逻辑回归模型的ROC(受试者工作特征)曲线;d. 阳性人群和阴性人群分娩的Kaplan...
结果提示模型预测性能良好,3个验证组AUC分别为(0.71,0.72,0.74),灵敏度分别是(75%,56%,60%),特异性分别为(56%,69%和100%)。 Fig. 2 | A subset of cfRNA changes can predict risk of preeclampsia early in gestation. 子痫前期是一种多因素...
在先兆子痫的母亲和血压正常母亲之间的cfRNA结果中发现,妊娠期和产后共有544 个差异表达基因(DEG)发生了改变。大多数DEG被注释为蛋白质编码,小部分(8%)是其他类型,包括11个线粒体转移RNA、6个长非编码RNA、8个假基因和1个小核仁RNA(snoRNA)。这些基因表达的变化在妊娠 20 周之前最为显著。
(Fig.4C). DEG enrichment analysis found that compared with HD 140Q-KI mice injected with AAV-CasRx/Ctrl gRNA, the gene expression levels of HD 140Q-KI mice treated with CRISPR/CasRx were closer to those of WT mice used as control (Fig.4D). We conducted Gene Set Enrichment Analysis (...
对82个基因进行了KEGG和GO分析。KEGG分析显示,坏死性凋亡相关的DEG主要存在于坏死性病变中(图2B)。图2C显示了GO分析结果,包括生物过程(BP)、细胞成分(CC)和分子功能(MF)。在BP中,DEGs主要富集于坏死性凋亡细胞死亡等;在CC中,DEGs主要存在于蛋白质- DNA复合物中;在MF,DEGs在蛋白质异构化活性中表达。
例如,具有高平均表达的髓质DEG包括在源自髓质的疾病中具有公认作用的基因,如UMOD和SLC12A1。相反,皮质DEG包括线粒体细胞色素c氧化酶复合物(MT-CO1,MT-CO3)和醛缩酶B(ALDOB)等代谢酶的成员,这与肾皮质中最丰富的细胞类型近端小管上皮细胞的高代谢活性和能量需求一致。因此,仅使用少量精心注释的参考样本,作者就能...
Jaffrey研究团队[36,37]于2019年提出一种Pepper RNA响应的“荧光响应蛋白”探针, 应用于活细胞RNA成像(图1C). Jaffrey团队[36]首先开发一种Pepper RNA结合的tDeg短肽. tDeg短肽包含19个氨基酸, 可以招募蛋白酶体, 降解自身或tDeg融合的荧光蛋白(tDeg-FP), 无荧光信号. 此外, 进一步发展Pepper RNA, 可特异...
a.比较28 HAS与0 HAS,48 HAS与28 HAS,48 HAS与0 HAS的DEG数;b.维恩图显示了不同萌发阶段上调和下调基因的重叠;c.种子萌发过程中所有DEG的GO分析 为了深入了解DEGS在种子萌发过程中的作用,对3个发芽期各DEGS的KEGG途径进行了分析。