RMSF(Root Mean Square Fluctuation)是分子动力学中的一个参数,用于描述分子在动力学过程中的结构波动情况,反
在分子动力学中,RMSF(Root Mean Square Fluctuation)是一个重要的参数,用于描述分子在动力学过程中的结构波动情况。 RMSF意义及其计算方法: RMSF反映了分子在模拟过程中原子位置的波动程度。计算方法通常是将每个原子在三维空间中的坐标进行平方,然后求平均值,最后开平方根。在计算RMSF时,通常选取一定时间窗口内的原子...
RMSF 的意义主要体现在以下几个方面: 1.反映分子结构稳定性:RMSF 值越小,说明分子结构越稳定,各原子间的距离波动越小。 2.影响分子动力学模拟的精度:RMSF 是分子动力学模拟中一个重要的输入参数,若设置不当,可能导致模拟结果与实际现象相差较大。 3.用于评估分子间相互作用力的准确性:RMSF 可用于评估分子间相互...
(Xi(tj)-xi)就是t时刻某个原子的位置减去初始时刻它的位置(也是位置偏移量),然后取所有时刻(可以理解为50w个2fs)的偏移量的平方和,然后对时间T取平均,然后开方,就是这个原子在时间T内,相对于初始时刻的RMSF。到这里,区别就明显了:RMSD一般是说的某个时刻相对于参考构象的结构偏差;而RMSF是说的一段时间内,...
RMSF的中文解释为"落基山斑疹热"，这种疾病在英语中是人犬共患的立克次体病，常见于狗和人类，且由扁虱传播，可能引发斑疹伤寒症和拖拉伦斯菌病。在医学领域，RMSF是与这些疾病相关的专业术语。虽然RMSF主要应用于医学和昆虫学领域，但在日常交流中，人们可能会在描述相关研究或疾病预防时使用这个缩写。
在轨迹分析中，RMSD（均方根偏差）和RMSF（均方根波动）是两个常用的指标，它们通过对位移的平方和求平均值来衡量结构的稳定性。RMSD关注的是单个时间点上结构相对于参考构象的偏差，计算方法是取每个原子位置与参考位置的偏移量平方和，再除以原子数并开方。例如，对于1ns的轨迹，每2fs保存一帧，50万...
RMSF的定义如下: RMSF 可以看到,RMSF计算的是一个粒子在时间T内,其位置的偏移量之平方和随时间的平均后再开方。RMSF的计算可以写成积分的形式,时域上(0,T)区间的积分。 RMSF和粒子的B-factor是相关的。可以参考如下资料: http://en.wikipedia.org/wiki/Debye%E2%80%93Waller_factor ...
rmsf网络落基山斑疹热(Rocky Mountain spotted fever);落基山斑点热(Roeky Mountain Spotted Fever);微球型聚焦电阻率 网络释义 1. 落基山斑疹热(Rocky Mountain spotted fever) 尽管它的名字是落基山斑疹热(RMSF),但它发生于整个美国、加拿大西部的部分地区和墨西哥及中南美。目前。www.cndog.net|基于39个网页 2. ...
计算之道 RMSD VS RMSF 说来惭愧,这两个玩意儿用了几年了,闭着眼睛竟然写不出来公式,忙了几天现在抽出时间了,闭着眼睛写一下。 RMSD,Root Mean Square Deviation,均方根偏差;RMSF,Root Mean Square Fluctuation,均方根波动。 在轨迹分析中,最经常用,最简单,也最有用的就是这两巨头,二者都是对位移的平方和...
落基山斑疹热(RMSF)又称为斑疹热;蜱热;蜱传斑疹伤寒落基山斑疹热是由犬蜱和安氏革蜱传播的一种潜在致命的立克次体感染。它引起皮疹、头痛和高热。带菌蜱叮咬可致人感染。可出现严重头痛、寒战、极度衰竭及肌痛,几天后皮疹出现。避免蜱叮咬是预防感染的最佳方法。如被蜱叮咬出现典型症状应立即开始抗菌治疗。落基山斑...