简介 通过染色质免疫沉淀(ChIP)检测和测序技术相结合,ChIP测序(ChIP-Seq)成为鉴定转录因子及其他蛋白因子在全基因组范围内的DNA结合位点的强有力方法。在ChIP操作之后,通过特异抗体将DNA结合蛋白免疫沉淀。…
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ChiPseq Ripseq ATACseq m6Asq等各类富集鉴定结果表有peaks而IGV查看无峰是什么原因呢纪伟讲测序 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多265 -- 0:59 App 想确定某个基因是否有功能时?也可以考虑基因突变分析 696 -- 0:36 App 想通过单细胞数据,看看某个基因的表达的差异.,作图展示形式。。 202...
RIP-Seq：用于构建目的蛋白的RNA互作组数据，或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。RIP-Seq是一...
通常,ChIP 用来检测某种特异蛋白或某种特异蛋白修饰在某个基因组区域的相对丰度。并依赖于使用一种抗体从细胞或组织提取物蛋白混合物中分离某种蛋白、组蛋白、转录因子或辅因子及其结合的染色质,或使之沉淀。因此,这种技术的名称为:染色质免疫沉淀法。在 ChIP-PCR 或 ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂...
2、而所谓的CoIP、CHIP、RIP的区别就在于B了。CoIP的B是一种蛋白质，CHIP是DNA，RIP是RNA。CoIP又叫...
RIP可以看成是染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物。RIP反应体系中的试剂和抗体不能含有RNA酶,抗体需经RIP实验验证等等。实验流程:样品裂解-抗体孵育-磁珠孵育-RNA纯化-qPCR或测序。RIP-seq和RIP-qPCR实验技术有哪些相同点。安徽RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR...
在原理上，RIP与ChIP非常相似，可以理解为只是研究对象不同，RIP主要是研究蛋白-RNA间的互作情况。这些RNA可以是mRNA、非编码RNA甚至病毒RNA等。在实验方案和步骤上，RIP也有自身特别需要注意的地方，后面将会一一介绍。RIP实验可根据目的分为两种情况，一种是探索性实验，另一种是验证实验。具体讲，第一种是靶RNA未知...
RIP(RNA结合蛋白免疫沉淀)和ChIP(染色质免疫沉淀)实验在多个方面存在明显的区别:研究对象:RIP实验主要研究细胞内RNA与蛋白质的相互作用,关注RNA结合蛋白与特定RNA分子的结合情况。ChIP实验则主要关注DNA与蛋白质的相互作用,特别是染色质上的蛋白质与DNA序列的结合。实验原理:RIP实验基于RNA分子与RNA结合蛋白在特定条件下...
关于RIP与clip-seq的比较 image.png 3、数据分析 基本流程分析还是类似于chip-seq; 数据质控→ 找peak → peak 分析; 新的研究思路还是需要阅读相关文献。 image from 达澈生物 image from 达澈生物 最后推荐一个研究RNA结构的必备网站:ENCORI,里面有很多公共clip-seq数据等 ...