现在Ribo-seq得到SRR8434774_trim.fastq.gz,SRR8434775_trim.fastq.gz,SRR8434776_trim.fastq.gz,三个文件。 作者用番茄SL2.5的参考基因组和ITAG2.4去掉了测序中的rRNA,tRNA,snRNA等等,用SL3参考基因组ITAG3.2版本注释去出数据中基因组重复序列。将SL2.5和ITAG2.4中对ncRNA的注释下载下来,根据注释提取序列,并且建bow...
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翻译组（Ribo-seq）加上精准定量的转录组（UMI转录组），不仅可以揭示 mRNA 翻译效率，还可以在翻译层面...
可以参考R包riboprofiling的文档
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