Ribosome profiling(Ribo-seq)是一种可以在全基因组水平上监测蛋白质翻译水平的高通量测序方法,给研究细胞内蛋白质的翻译调控机制带来了新的可能。但Ribo-seq的数据并不是仅限于进行蛋白质翻译效率的评估。Ribo-seq同样可以用于进行RNA结合蛋白保护的RNA片段的鉴定。今天要分析的这项研究就是基于Ribo-seq数据开发了Rfo...
现在Ribo-seq得到SRR8434774_trim.fastq.gz,SRR8434775_trim.fastq.gz,SRR8434776_trim.fastq.gz,三个文件。 作者用番茄SL2.5的参考基因组和ITAG2.4去掉了测序中的rRNA,tRNA,snRNA等等,用SL3参考基因组ITAG3.2版本注释去出数据中基因组重复序列。将SL2.5和ITAG2.4中对ncRNA的注释下载下来,根据注释提取序列,并且建bow...
Ribo_seq数据分析软件是由天津诺禾致源科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2023SR0991999,属于分类,想要查询更多关于Ribo_seq数据分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
诺禾致源目前已经积累的 Ribo-seq 项目经验有：人、猴子、鸡、小鼠、仓鼠、大鼠、小麦、拟南芥、棉花、...
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可以参考R包riboprofiling的文档
数据分析之数据分析软件 数据分析是指用适当的统计分析方法对收集来的大量数据进行分析,将它们加以汇总和理解并消化,以求最大化地开发数据的功能,发挥数据的作用。数据分析是为了提取有用信息和形成结论而... 不会写Python的IT 2022-12-28 常用Python数据分析工具汇总 Python是数据处理常用工具,可以处理数量级从...