参考基因组上的allele多为major allele,但这只是巧合,不能以此为依据将major和 reference allele划上等号,也有部分reference allele在该群体中为minor allele。 与plink1.9不同,plink2使用的概念则是reference 与 alternative allele,进行操作时不会自动依据频率而改变ref与alt的排序,使用plink2 的—frq选项计算频率,你...
2. 与参考基因组相关的reference与alternative allelereference和alternative allele的概念不再与频率挂钩,而是基于所选择的参考基因组。参考基因组上的allele往往被标记为major,但并非总是如此。在PLINK 2中,ref和alt的概念保持明确,如SNP1的T是ref allele,但因其在群体中的频率较低,也是minor allele。
Alternative strategies for development of a reference transcriptome for quantification of allele specific expression in organisms having sparse ... Shen, Y.Garcia, T.Pabuwal, V.Boswell, M.Pasquali, A.Beldorth, I.Warren, W.Schartl, M.Cresko, W.A.Walter, R.B. - 《Comparative Biochemistry &...
它构成或部分构成以下单词: adulteration; adultery; alias; alibi; alien; alienate; alienation; allegory; allele; allergy; allo-; allopathy; allotropy; Alsace; alter; altercation; alternate; alternative; altruism; eldritch; else; hidalgo; inter alia; other; outrage; outrageous; outre; parallax; parall...