很明显，我们看到所有的轴的长度均小于3，因此通过该方法预测，我们应该选择RDA分析。当然，如果你并不相信以上运算的结果，比较稳健的方法是同时计算RDA和CCA比较这两个分析中环境因子对物种分布的解释量大小，选择解释量大的那种方法即可。2、RDA和CCA test.rda<-rda(varespec,varechem)#RDA分析 test.rda#79.97%...
PCA、PCoA和NMDS分析属于非约束性排序分析,而RDA/CCA和db-RDA分析属于约束性排序分析,即分别是在环境因子的约束条件下进行的PCA和PCoA分析。因此,一般主要利用PCA、PCoA或NMDS分析进行样本比较,反映样本间菌群结构的相似性和差异性,从而分析组间样本能否明显区分开;而RDA/CCA和db-RDA分析则多用来阐述环境因子对样本菌...
通过同时做RDA和CCA我们发现,在RDA中环境因子对物种分布的解释量更高。 对结果的解读: constrained(约束)指自变量(环境)矩阵能对因变量矩阵(物种)的整体解释量,如RDA分析中的79.97%和CCA分析中的69.20%。 unconstrained(非约束)指还剩下的没有被解释的部分,如RDA分析中的20.03%和CCA分析中的30.80%。 如何获得每一...
解析 那是总变异!前面1、2、3、4四个轴共解释了99.2%的变异 结果一 题目 RDA和CCA分析中环境因子和物种相关性达到1是什么意思?下图如何分析 答案 那是总变异!前面1、2、3、4四个轴共解释了99.2%的变异相关推荐 1RDA和CCA分析中环境因子和物种相关性达到1是什么意思?下图如何分析 反馈 收藏 ...
在线性排序图，从样方的点在物种箭头及其延长线的投影点可以表示他们之间的关系。在图中，我们可以预测，物种Spc_2的丰度最大的样方应该是在样方Sa4，其次是Sa2，在样方Sa3和Sa1里丰度接近平均值， Sa5里面丰度最小。样方点之间的距离可以代表它们之间的关系。如图，我们可以预测样方Sa5与Sa2相似度最...
RDA和CCA分析中环境因子和物种相关性达到1是什么意思?下图如何分析 下载作业帮APP学习辅导没烦恼 答案解析 结果1 举报 那是总变异!前面1、2、3、4四个轴共解释了99.2%的变异 APP内打开 为你推荐 查看更多 如何用canoco进行物种与环境因子的分析 用实验分析 23981 要把一个物种称为活化石,必须具备那些条件?你能...
那是总变异！ 前面1、2、3、4四个轴共解释了99.2%的变异 请问
在线性排序图,从样方的点在物种箭头及其延长线的投影点可以表示他们之间的关系。在图中,我们可以预测,物种Spc_2的丰度最大的样方应该是在样方Sa4,其次是Sa2,在样方Sa3和Sa1里丰度接近平均值, Sa5里面丰度最小。 样品和样品 样方点之间的距离可以代表它们之间的关系。如图,我们可以预测样方Sa5与Sa2相似度最高...
test.cca#69.20% 通过同时做RDA和CCA我们发现,在RDA中环境因子对物种分布的解释量更高。 对结果的解读: constrained(约束)指自变量(环境)矩阵能对因变量矩阵(物种)的整体解释量,如RDA分析中的79.97%和CCA分析中的69.20%。 unconstrained(非约束)指还剩下的没有被解释的部分,如RDA分析中的20.03%和CCA分析中的30.80...