研究人员借助功能化的纳米针芯片，利用其独特的高纵横比结构和良好的生物相容性的优势，开发出了在单细胞空间分辨率下检测lncRNA-RBP相互作用的技术。这种创新的方法可以同时捕获目标lncRNA及其相关的RBP，并将它们从活细胞内环境中分离出来。随后，将分离的蛋白直接在纳米针芯片上进行检测和可视化，使其信号与lncRNA的...
作者初期也是打算从传统的RBP机制着手的,只是随着实验的进行发现了一个崭新的RBP调控机制,即lncRNA SLC26A4-AS1通过招募E3泛素连接酶TRIM25促进其靶蛋白DDX5的降解,进而影响下游DNA损伤修复相关通路的活性,进而影响甲状腺癌的转移。
研究人员借助功能化的纳米针芯片,利用其独特的高纵横比结构和良好的生物相容性的优势,开发出了在单细胞空间分辨率下检测lncRNA-RBP相互作用的技术。这种创新的方法可以同时捕获目标lncRNA及其相关的RBP,并将它们从活细胞内环境中分离出来。随后,将分离的蛋白直接在纳米针芯片上进行检测和可视化,使其信号与lncRNA的信号...
研究人员借助功能化的纳米针芯片,利用高纵横比结构和良好的生物相容性的优势,开发出了在单细胞空间分辨率下检测lncRNA-RBP相互作用的技术。这种创新的方法可以同时捕获目标lncRNA及其相关的RBP,并将它们从活细胞内环境中分离出来。随后,将分离的蛋白直接在纳米针芯片上进行检测和可视化,使其信号与lncRNA的信号共定位,从...
研究人员首先将常规TNBC细胞转移到裸鼠脂肪垫中,筛选高淋巴结浸润性细胞重新注射到新的裸鼠体内,重复操作后,利用全基因组芯片筛选第三代高淋巴结浸润性细胞(231LNM3、549LNM3)中差异表达lncRNA,确定HUMT,用qRT-PCR验证,并进一步利用TCGA数据分析TNBC组织及泛癌组织中HUMT的表达水平进行验证。
本教程进行了复原,并且自噬的方向可以为自己感兴趣的方向,比如缺氧免疫RBP铁死亡代谢等方向,lncRNA的预后模型具有创新性,生信分析好处结果,毕业及晋升可适用。生存曲线 roc曲线生存模型 单多因素分析准备 列线图校准图以及c指数线性相关图知识 科学科普 生物 科学 sci套路 SCI 医学 毕业论文 基因 数据挖掘 生物信息 ...
专利摘要:一种注意力机制预测lncRNA的RBP结合位点的方法,其属于生物信息学领域。该方法采用一种基于高阶统计的编码方法,利用序列特征进行高维空间表示作为模型输入。在基准数据集上对Att_Cnn_Caps模型进行评价,取得了比传统分类器更高的分类精度,采用了基于注意机制、卷积神经网络的联合处理层。它能够针对输入矩阵的不同...
免疫细胞的分化和功能受多种因素调控,长链非编码RNA(LncRNA)是免疫系统的重要调控者.研究表明LncRNA分子具有较高的谱系特异性并调控免疫细胞的分化和功能,多数LncRNA分子需要与RNA结合蛋白(RBP)结合并通过多种方式发挥调节功能.为更好地总结LncRNA分子与RBP在免疫细胞发育,分化及效应功能中的研究进展,本文从LncRNA...
Revealing protein-lncRNA interaction. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are associated to a plethora of cellular functions, most of which require the interaction with one or more RNA-binding prote... Fabrizio,Ferrè,Alessio,... - 《Briefings in Bioinformatics》 被引量: 43发表: 2016年 Quantitative...
RNA-protein interactionPlant lncRNA predictionBackground: Long noncoding RNAs (lncRNAs) are endogenous noncoding RNAs, arbitrarily longer than 200 nucleotides, that play critical roles in diverse biological processes. LncRNAs exist in different genomes ranging from animals to plants. Objective: PlncRNADB...