研究人员借助功能化的纳米针芯片，利用其独特的高纵横比结构和良好的生物相容性的优势，开发出了在单细胞空间分辨率下检测lncRNA-RBP相互作用的技术。这种创新的方法可以同时捕获目标lncRNA及其相关的RBP，并将它们从活细胞内环境中分离出来。随后，将分离的蛋白直接在纳米针芯片上进行检测和可视化，使其信号与lncRNA的...
作者初期也是打算从传统的RBP机制着手的,只是随着实验的进行发现了一个崭新的RBP调控机制,即lncRNA SLC26A4-AS1通过招募E3泛素连接酶TRIM25促进其靶蛋白DDX5的降解,进而影响下游DNA损伤修复相关通路的活性,进而影响甲状腺癌的转移。
揭示lncRNA与RBP在活细胞中的相互作用对于研究它们在各种生物活动中的作用具有重要意义,然而目前传统方法均需要对细胞进行裂解,然后分离出细胞中的目标物,从而失去活细胞中的动态异质性信息。 最近,中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所的裴仁军、王子迅团队联合香港城市大学史鹏团队开发了一种分子信标功能化的纳米针芯片...
为确定HUMT调节TNBC癌症进展的具体机制,研究人员利用lncATLAS预测,核质分离结合qRT-PCR以及FISH验证HUMT的亚细胞定位,确定近一半lncRNA位于细胞核。 (胖师兄:反正么得图,没图没真相) lncRNA通过招募相应蛋白在转录中起重要作用,GEO数据分析显示DNA结合蛋白YBX1可能与HUMT结合,RIP结合RNA pulldown确定两者的结合关系。YBX...
揭示lncRNA与RBP在活细胞中的相互作用对于研究它们在各种生物活动中的作用具有重要意义,然而目前传统方法均需要对细胞进行裂解,然后分离出细胞中的目标物,从而失去活细胞中的动态异质性信息。最近,中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所的裴仁军、王子迅团队联合香港城市大学史鹏团队开发了一种分子信标功能化的纳米针芯片...
揭示lncRNA与RBP在活细胞中的相互作用对于研究它们在各种生物活动中的作用具有重要意义,然而目前传统方法均需要对细胞进行裂解,然后分离出细胞中的目标物,从而失去活细胞中的动态异质性信息。 最近,中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所的裴仁军、王子迅团队联合香港城市大学史鹏团队开发了一种分子信标功能化的纳米针芯片...
研究人员首先将常规TNBC细胞转移到裸鼠脂肪垫中,筛选高淋巴结浸润性细胞重新注射到新的裸鼠体内,重复操作后,利用全基因组芯片筛选第三代高淋巴结浸润性细胞(231LNM3、549LNM3)中差异表达lncRNA,确定HUMT,用qRT-PCR验证,并进一步利用TCGA数据分析TNBC组织及泛癌组织中HUMT的表达水平进行验证。
另外,2021年1月11日,清华大学杨雪瑞团队在Cell Research在线发表题为“Mutual dependency between lncRNA LETN and protein NPM1 in controlling the nucleolar structure and functions sustaining cell proliferation”的研究论文,该研究揭示了...
他们使用同位素标记氨基酸(SILAC)培养细胞,通过紫外交联Xist与RNA结合蛋白(RNA binding Protein,RBP),同时用靶向Xist的反义核酸探针与lncRNA杂交,形成稳定的RNA-DNA杂交产物,后利用Protein G beads捕获探针及探针所结合的复合体,解交联后分离Xist和RBP,通过质谱鉴定RBP组成。
本教程进行了复原,并且自噬的方向可以为自己感兴趣的方向,比如缺氧免疫RBP铁死亡代谢等方向,lncRNA的预后模型具有创新性,生信分析好处结果,毕业及晋升可适用。生存曲线 roc曲线生存模型 单多因素分析准备 列线图校准图以及c指数线性相关图知识 科学科普 生物 科学 sci套路 SCI 医学 毕业论文 基因 数据挖掘 生物信息 ...