xanchor指定了数据(data)或绘制分数(plot fraction)的 x 位置,但是x0、x1和path中的x坐标 是相对于xanchor的像素,这样,shape可以有一个固定的宽度,同时保持一个相对于数据(data)或绘制分数(plot fraction)的位置。
Dotplot函数隶属于Seurat包,是由Rahul Satija, Satija Lab and Collaborators开发的。Rahul Satija是基因组学家和计算生物学家,拥有杜克大学生物学和音乐学的学士学位,并在牛津大学获得统计学的博士学位。2015年时,Satija 和他在剑桥麻省理工Broad研究所的同事(还包括他的博士后导师 Aviv Regev)发布了第一版的 Seurat...
# Seurat::DotPlot() p <- DotPlot(object = pbmc, features = top3pbmc.markers$gene) # 提取并重新整理绘图数据 df<- p$data exp_mat <- df %>% dplyr::select(-pct.exp, -avg.exp) %>% pivot_wider(names_from = id, values_from = avg.exp.scaled) %>% as.data.frame() row.names(...
哑铃图（ dumbbell plot）：可以看成多数据系列的点图，只是使用直线连接了两个数据系列的数据点。哑铃图主要用于：①展示在同一时间段两个数据点的相对位置（增加或者减少）；②比较两个类别之间的数据值差别。下面是用ggplot2作图 棒棒糖图 library(ggplot2)library(reshape2)mydata<-read.csv("DotPlots_Data.csv...
富集分析气泡图dotplot, 本脚本只需要一个表格数据(如果是clusterProfiler包输出的富集分析结果可直接使用),也可以是其他软件工具的结果,按需改成本脚本所需格式即可。
通过ggplot函数开始构建图形,使用geom_dotplot添加点。 AI检测代码解析 # 创建Dotplotdotplot<-ggplot(data,aes(x=类别,y=值))+# 定义x轴和y轴geom_dotplot(binaxis='y',stackdir='center',dotsize=1)+# 添加点图labs(title="Dotplot示例",x="类别",y="值")# 添加标题和标签 ...
dotchart(x)如果x是数据框,作Cleveland点图(逐行逐列累加图)fourfoldplot(x)用四个四分之一圆显示2X2列联表情况(x必须是dim=c(2,2,k)的数组,或者是dim=c(2,2)的矩阵,如果k=1)assocplot(x)Cohen–Friendly图,显示在二维列联表中行、列变量偏离独立性的程度mosaicplot(x)列联表的对数线性回归残差的...
geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', position=position_dodge(0.9)) 3. 添加errorbar和pointrange data %>% ggplot(aes(group, value, fill = name)) + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', position=position_dodge(0.9)) + ...
p + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=1) #点发散 p + geom_jitter(shape=16, position=position_jitter(0.2)) 2.4 上色 定义颜色的代码跟前两章柱状图箱线图的一样,都对应着线框颜色和填充颜色。 2.5 柱状小提琴复合图 ...
plot(density(x)) 其中x是一个数值型向量 plot()函数会创建一幅新的图形,所以要向一幅已经存在的图形上叠加一条密度曲线,可以使用lines()函数。 (2)例1: d <-density(mtcars$mpg)#returnsthe density dataplot(d)#plotsthe results (3)核密度图直方图叠加: ...