在人类细胞中可以在端粒处检测到TERRA产生的R-loop。 2.2. 端粒的不稳定 Telomere instability 由UUAGGG重复序列组成的RNA足以通过RAD51重组酶介导的机制在转录时形成端粒R-loop,并且端粒R-loop的形成会增加端粒的脆性。因此,端粒R-loop使TERRA能够与端粒结合并维持端粒,但也会产生基因组不稳定性。 对TERRA和端粒R-...
当R-loop的调控失衡时,病理性R-loop的累积会导致疾病,如神经退行性疾病和癌症。在本篇综述中,我们讨论了对R-loop和RNA-DNA杂合片段来源的当前理解,抑制和解决这些结构的机制,以及这些结构对DNA修复和基因组稳定性的影响,以及治疗性靶向病理性R-loop的机会。 前言 R-loops是包含RNA-DNA杂合片段和一条移位的DNA链...
机制研究表明,HOTTIP能够在TAD边界上通过反式作用,在β-catenin基因两侧的两个不同CTCF蛋白结合位点形成R-loop,通过招募CTCF等与TAD形成相关的蛋白到相应位置,直接强化了CTCF染色质边界并促进包含β-catenin基因的TAD形成,从而驱动癌基因转录和白血病的发展(图7)。 图7 lncRNA HOTTIP通过反式作用,在β-catenin基因两侧...
R-loop，即由RNA:DNA杂交链与一条被置换的单链DNA构成的特殊三链核酸结构，广泛存在于从动物、植物到细菌等各类生物体的基因组中。现有研究指出，R-loop作为细胞内的关键调节因子，在DNA复制、同源重组、DNA损伤修复及转录等核心生理过程中具有重要作用。在我们先前的文章《特殊DNA-RNA互作R-loop丰富基因转录的表观...
提出探究R-loops对DNA损伤识别和修复的影响,以及其如何增加基因组不稳定性,从而提高癌症发病风险的研究问题。 设计实验验证R-loops在DNA损伤和癌症发病中的确切机制,可以通过细胞系的实验或小鼠模型。 在研究计划中明确实验方法,例如使用免疫沉淀技术检测R-loops的形成,以及通过RNA-Seq等技术研究与R-loops相关的基因表达...
R-loop是细胞内一种特殊的三链核酸结构,由一条mRNA链、一条DNA模板链和一条DNA非模板链所组成(如图),它在基因的CpG岛(CpG岛是DNA上富含GC的区域,多位于基因的启动子处)形成,广泛分布在人类基因组中。GADD45A蛋白能识别、结合细胞内的R-Loop,募集去甲基化酶TET1,从而介导CpG岛去甲基化,促进相关基因的表达,在...
loop是含有RNA-DNA的杂合核酸，具有多种重要的细胞作用。R-loop的动态调节异常会导致DNA损伤和基因组不稳定【1】。研究表明R-loop的调节可能与XPG等内切酶活性相关【2-4】。但是目前R-loop的动态调节机制以及出现错误调节后所引发的细胞内后果仍不清楚。近日，美国斯坦福大学 Karlene A. Cimprich研究组在Nature发表...
R-loop 是新生 RNA 与其模板 DNA 稳定杂交时形成的结构,导致非模板 DNA 链被挤出为长而稳定的单链 DNA (ssDNA)。 近年来,有大量出版物证明了 R-loop 在基因组中的广泛存在,对各种生物过程都有影响。 例如,R-loop 与染色质调节因子的募集、异染色质形成和转录终止有关。 重要的是,过多的 R-loop 与 DNA...
loop是含有RNA-DNA的杂合核酸,具有多种重要的细胞作用。R-loop的动态调节异常会导致DNA损伤和基因组不稳定【1】。研究表明R-loop的调节可能与XPG等内切酶活性相关【2-4】。但是目前R-loop的动态调节机制以及出现错误调节后所引发的细胞内后果仍不清楚。
R-loop,即由RNA:DNA杂交链与一条被置换的单链DNA构成的特殊三链核酸结构,广泛存在于从动物、植物到细菌等各类生物体的基因组中。现有研究指出,R-loop作为细胞内的关键调节因子,在DNA复制、同源重组、DNA损伤修复及转录等核心生理过程中具有重要作用。 在我们先前的文章