以下是R-loop形成的主要机制: 转录过程:R-loop的形成通常始于DNA上的一个基因或转录启动区域。在转录过程中,RNA聚合酶(RNA polymerase)通过DNA模板合成RNA链。 RNA-DNA杂交:在DNA的某个区域,RNA链会与DNA链形成互补配对。这种RNA-DNA杂交形成了一个稳定的三链结构,其中两条链是DNA,一条链是RNA。 DNA链解旋:R...
设计实验验证R-loops在DNA损伤和癌症发病中的确切机制,可以通过细胞系的实验或小鼠模型。 在研究计划中明确实验方法,例如使用免疫沉淀技术检测R-loops的形成,以及通过RNA-Seq等技术研究与R-loops相关的基因表达变化。 02/DICER在RNA干扰途径中的作用 探讨DICER在RNA干扰途径中的关键作用,尤其是对抗外源双链RNA的作用,...
机制研究表明,HOTTIP能够在TAD边界上通过反式作用,在β-catenin基因两侧的两个不同CTCF蛋白结合位点形成R-loop,通过招募CTCF等与TAD形成相关的蛋白到相应位置,直接强化了CTCF染色质边界并促进包含β-catenin基因的TAD形成,从而驱动癌基因转录和白血病的发展(图7)。 图7 lncRNA HOTTIP通过反式作用,在β-catenin基因两侧...
loop是含有RNA-DNA的杂合核酸，具有多种重要的细胞作用。R-loop的动态调节异常会导致DNA损伤和基因组不稳定【1】。研究表明R-loop的调节可能与XPG等内切酶活性相关【2-4】。但是目前R-loop的动态调节机制以及出现错误调节后所引发的细胞内后果仍不清楚。近日，美国斯坦福大学 Karlene A. Cimprich研究组在Nature发表...
在这项新的研究中,这些作者着重关注长链非编码增强子RNA(long non-coding enhancer RNA, Inc-eRNA),这是一种特定类型的lncRNA,与靶基因的调节区域相互作用。在与特定基因结合后,Inc-eRNA可以形成称为R环(R-loop)的独特结构,以帮助控制这些基因。 他们研究了一个名为NPAS4的基因,该基因与压力诱导的快感缺失或曾...
【Cell】R-Loop 从生理到病理 摘要 DNA-RNA杂交体在细胞过程中起着生理作用,但通常,它们代表的是非计划的共转录结构,对转录、复制和DNA修复产生负面影响。越来越多的证据表明,它们构成了复制应激、DNA断裂和基因组不稳定性的来源。反过来,DNA断裂通过释放双螺旋构象,促进了DNA-RNA杂交体的形成。细胞通过防止...
R-loop(R环)是细胞内普遍存在的动态三链核酸结构,在DNA复制与修复、染色质与转录调控、端粒维持、介导CRISPR以及长非编码核糖核酸(lncRNA)基因组定位中发挥着重要作用[1-4]。R-loop由DNA-RNA杂合双链和被RNA链局部置换的单DNA 链组成,普遍...
在转录过程中,r环(R-loop)的形成是一个重要的现象。本文将详细介绍转录过程中r环的形成机制、功能以及与疾病相关的研究进展。 2. 转录的基本过程 转录是生物体内基因表达的关键步骤之一,它是通过RNA聚合酶酶解合成RNA的过程。转录过程包括以下几个步骤: 1.识别起始位点:RNA聚合酶通过与启动子结合,识别起始位点。
R-loop调控基因表达机制涉及转录调控，如启动子区的R-loop促进DNA甲基化和抑制因子结合，转录终止区的R-loop招募解旋酶解除结构，促使RNA降解和转录终止。例1：lncRNA HOTTIP异常激活通过形成R-loop调节CTCF结合活性和TAD完整性，影响造血干细胞，促进白血病发展。例2：特定R-loop诱导CGG重复收缩，重新激活...
但另一方面呢,r - loop如果调皮过度,也会带来一些麻烦。就像那个在工厂里捣乱的小助手RNA一样,如果r - loop在细胞里形成得太多或者出现在不该出现的地方,就可能会干扰DNA的正常功能。比如说DNA要进行复制的时候,r - loop就像一个障碍物一样横在那里,可能会导致DNA复制出错,就像工人按照被捣乱后的图纸生产东西,...