随后,该综述重点介绍了植物中R-loop研究进展,描述了拟南芥、玉米、水稻和杨树等植物中R-loop在全基因组分布特征,并详述了R-loop在植物基因组转录复制、RNA加工、染色质三维结构调控、基因组稳定性维持等过程中的生物学功能(图1)。最后,该...
TERRA是从亚端粒区转录出的含端粒重复序列的长链非编码RNA,可入侵到DNA双链中,与模板链形成RNA: DNA杂合链,称为R-loop结构。研究表明,R-loop结构可调控DNA相关的生物学过程,包括转录终止、基因调控、端粒稳态和 DNA损伤修复等,R-loop失调会造成如DNA损伤、转录延伸缺陷、染色体重组等基因组不稳定因素。其中R-loop...
功能研究发现CRM1来源的环状RNA通过R-loop结构结合在着丝粒区域,来调节染色质构象,从而影响着丝粒区特异组蛋白CENH3定位(Liu et al.,PLOS Biology, 2020.)。为了进一步理解R-loop结构在着丝粒区的分布特征,该研究组利用ssDRIP-seq技术首次开展了玉米全基因组R-loop图谱的绘制,发现R-loop呈现着丝粒和近着丝粒富集的特...
在本项研究中娄继忠课题组综合利用生物化学单分子荧光技术及计算生物学方法对酿脓链球菌cas9streptococcuspyogenescas9spycas9蛋白复合体识别靶dna并形成rloop复合体过程的分子机制进行了较为系统的研究 娄继忠课题组在CRISPR-Cas9系统R-loop复合体形成机制研究中获得进展 2017年11月14日,Nucleic Acids Research杂志在线发表了...
在众多生物体中发挥着重要的生物学功能.生物体内有众多调控因子通过调节R-loop的稳态来影响各水平的基因组调控事件,如转录,复制,DNA损伤及修复等.近年来,随着R-loop的检测技术日益成熟,越来越多的R-loop生物学新功能正在被发现.本文归纳比较了不同的R-loop检测方法,并对植物R-loop生物学功能研究进展进行了重点阐述...
因子突变引起剪接异常的机制有所不同,但最终能导致相似的MDS表型,提示剪接因子突变可能导致不同于剪切异常的共同致病通路.近期研究发现,SF3B1,U2AF1,SRSF2突变能导致R-loop积累,引起DNA损伤及修复异常,并激活ATR-Chk1通路,最终导致细胞凋亡和肿瘤发生.文章就R-loop在MDS中的发病机制及相关靶向治疗药物的研究进展进行...
关于R-loop与基因组稳定性的关系,付向东教授团队2017年发表于Molecular cell杂志的研究采用非活性RNase H的R-ChIP揭示了基因启动子上R-loops与转录暂停的动态耦合,为RNA侵入双链DNA提供了一种拓扑解决方案,并提出了与既往报道方向相反的R-loop起始和延伸顺序。关联到肿瘤中,2018年,团队进一步发现,增强的R-loops与骨髓...
随后,该综述重点介绍了植物中R-loop研究进展,描述了拟南芥、玉米、水稻和杨树等植物中R-loop在全基因组分布特征,并详述了R-loop在植物基因组转录复制、RNA加工、染色质三维结构调控、基因组稳定性维持等过程中的生物学功能(图1)。最后,该论文探讨了植物基因组R-loop的研究方向及R-loop检测方法发展的新趋势,并对R...
随后,该综述重点介绍了植物中 R-loop 研究进展,描述了拟南芥、玉米、水稻和杨树等植物中 R-loop 在全基因组分布特征,并详述了 R-loop 在植物基因组转录复制、RNA 加工、染色质三维结构调控、基因组稳定性维持等过程中的生物学功能。最后,该论文探讨了植物基因组 R-loop 的研究方向及 R-loop 检测方法发展的新...
中国科学院遗传与发育生物学研究所韩方普研究组长期从事植物染色体生物学的研究。前期在玉米着丝粒区特异反转座子CRM1中鉴定到了3类环状RNA。功能研究发现CRM1来源的环状RNA通过R-loop结构结合在着丝粒区域,来调节染色质构象,从而影响着丝粒区特异组蛋白CENH3定位(Liu et al.,PLOS Biology, 2020.)。为了进一步理解R-loo...