运行 AI代码解释 library(readxl)dat01<-read_excel("data/20220711/41586_2022_4808_MOESM8_ESM.xlsx",sheet="Fig4e",skip=1)dat01library(ggplot2)dat01$Type<-factor(dat01$Type,levels=c("SNP","InDel","SV","SV array"))ggplot(data=dat01,aes(x=Type,y=Accuracy))+geom_line(aes(group=Metab...
group_by(CHR) %>% summarise(center=(max(BPcum)+min(BPcum))/2) axis.set 根据tissue列对数据进行筛选 dat <- dat_all[dat_all$tissue=="Plasma",] 作图代码 ggplot(data = dat, aes(x=BPcum,y=-log10(P), color=as.factor(CHR), size=-log10(P)))+ geom_point()+ scale_x_continuous(...
unique()函数是查看一组数据中有多少中元素,可以用来去重复 比如一个向量c(1,1,2,2,2,3,3,3,3) 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 unique(c(1,1,2,2,2,3,3,3)) image.png 加载需要用到的R包 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 library(ggplot2)library(scale...
跟着Nature学作图:R语言ggplot2山脊图添加辅助线 论文Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding https://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了… 牧羊的男孩...发表于R语言gg... 跟着Nature学作图:R语言ggplot2环形堆积柱形...
这个图的实现办法有很多,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2实现上图的代码。 首先是构造示例数据 构造两份数据 一份是最左侧的分组颜色条 一份是右侧展示数值的热图 构造数据用到的代码 x<-seq(0,1,by=0.001) set.seed(1234) x1<-sample(x,240) ...
2. 3. 4. 5. 6. 根据tissue列对数据进行筛选 dat <- dat_all[dat_all$tissue=="Plasma",] 1. 作图代码 ggplot(data = dat, aes(x=BPcum,y=-log10(P), color=as.factor(CHR), size=-log10(P)))+ geom_point()+ scale_x_continuous(labels = axis.set$CHR, ...
library(ggplot2)ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) 以mtcars为例,以wt为x轴,mpg为y轴用ggplot()先建立一个最基础的图层 ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) + geom_point() 通过"+" 在基础图层上添加上散点(geom_point()) ,得到一幅简单的散点图,后面还能添加更多的图层得到复杂的图形 映射...
方法2:使用 guides() library(ggplot2)# Base Plotgg<-ggplot(midwest,aes(x=area,y=poptotal))+geom_point(aes(col=state,size=popdensity))+geom_smooth(method="loess",se=F)+xlim(c(0,0.1))+ylim(c(0,500000))+labs(title="Area Vs Population",y="Population",x="Area",caption="Source: mi...
引言:在之前的章节中,我们已经学习了利用R的基础绘图功能创建一些普通图形和特殊图形,本章节我们将学习如何利用ggplot2包对复杂的数据集进行可视化。 后台回复“R语言实战”即可获取二维码加入R语言实战学习讨论群。 19.1 ggplot2包介绍 ggplot2包是使用R进行数据...
ggplot2绘图系统——图例:guide函数、标度函数、overrides.aes参数 图例调整函数 也属于标度函数,但不能单独作为对象使用,即不能如 使用。 1. guides及guides_legend函数 guide_legend函数参数: 结合 函数调整图例。 图例的四种形式: ,使用gu