运行 AI代码解释 library(readxl)dat01<-read_excel("data/20220711/41586_2022_4808_MOESM8_ESM.xlsx",sheet="Fig4e",skip=1)dat01library(ggplot2)dat01$Type<-factor(dat01$Type,levels=c("SNP","InDel","SV","SV array"))ggplot(
用 ggplot2 画图时,有一个默认的几何对象 geom_text 在图上添加文本,但有时候表现得并不好,比如文本与点重叠在一起,文本与文本之间重叠在一起。 简说基因 2023/12/01 1.2K0 没想到修个火山图这么麻烦 expressionsize函数教程数据 MAplot转录组差异基因表达展示_maplot r语言_TS的美梦的博客-CSDN博客自己也...
group_by(CHR) %>% summarise(center=(max(BPcum)+min(BPcum))/2) axis.set 根据tissue列对数据进行筛选 dat <- dat_all[dat_all$tissue=="Plasma",] 作图代码 ggplot(data = dat, aes(x=BPcum,y=-log10(P), color=as.factor(CHR), size=-log10(P)))+ geom_point()+ scale_x_continuous(...
df$Tier <- df$Tier %>% fct_relevel(c('A+','A','B','C','D','Other')) p1 <- df %>% ggplot(aes(x=Tier,y=Num_of_accounts)) + geom_bar(stat='identity',fill=plot_cols[2]) + coord_flip() + geom_text(aes(label=paste0(Pct_of_accounts,'%')), hjust=0.6, nudge_y =...
2. 3. 4. 5. 6. 根据tissue列对数据进行筛选 dat <- dat_all[dat_all$tissue=="Plasma",] 1. 作图代码 ggplot(data = dat, aes(x=BPcum,y=-log10(P), color=as.factor(CHR), size=-log10(P)))+ geom_point()+ scale_x_continuous(labels = axis.set$CHR, ...
这个图的实现办法有很多,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2实现上图的代码。 首先是构造示例数据 构造两份数据 一份是最左侧的分组颜色条 一份是右侧展示数值的热图 构造数据用到的代码 x<-seq(0,1,by=0.001) set.seed(1234) x1<-sample(x,240) ...
library(ggplot2)ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) 以mtcars为例,以wt为x轴,mpg为y轴用ggplot()先建立一个最基础的图层 ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) + geom_point() 通过"+" 在基础图层上添加上散点(geom_point()) ,得到一幅简单的散点图,后面还能添加更多的图层得到复杂的图形 映射...
🌳3.1.2 修改子图 🌴3.1.3 增加注释 🌎3.2 将多个图互相叠加在一个图中 💟文章推荐 💘3.将多张图形放在一起:包括并排绘制和插图 ggplot2默认的语法都是将每张图单独的放在一个画布中。即使上一章我们介绍的分面绘图给出了将多个子图画在同一个画布中, ...
引言:在之前的章节中,我们已经学习了利用R的基础绘图功能创建一些普通图形和特殊图形,本章节我们将学习如何利用ggplot2包对复杂的数据集进行可视化。 后台回复“R语言实战”即可获取二维码加入R语言实战学习讨论群。 19.1 ggplot2包介绍 ggplot2包是使用R进行数据...
方法2:使用 guides() library(ggplot2)# Base Plotgg<-ggplot(midwest,aes(x=area,y=poptotal))+geom_point(aes(col=state,size=popdensity))+geom_smooth(method="loess",se=F)+xlim(c(0,0.1))+ylim(c(0,500000))+labs(title="Area Vs Population",y="Population",x="Area",caption="Source: mi...