第二,在pP1192R和原核Topo ias中,一个独特的a ' α10 '螺旋位于进化上保守的a ' α10螺旋的外围,并与a ' α10螺旋和a ' α14螺旋相互作用。此外,在pP1192R中发现了位于TOPRIM结构域DNA结合界面的两个结构特征,即a ' α...
r语言ic50曲线 在R语言中绘制IC50曲线,通常涉及到将实验数据拟合成量效关系模型,并基于模型参数计算出IC50值(即半抑制浓度),然后利用这些数据和计算结果绘制图形。以下是一个简化的示例流程: 1、数据准备: 你需要有一组药物浓度与响应度的数据,例如,每个浓度下测定的细胞存活率或者酶活性等。 2、拟合模型: 常用的...
基于此,开展了一项国际多中心II期临床研究——ROSEWOOD研究,旨在比较泽布替尼联合奥妥珠单抗对比奥妥珠单抗单药在R/R FL患者中的疗效和安全性,本研究结果发表于J Clin Oncol杂志(IF:42.1)。研究共纳入217例1-3a级FL患者,既往接受...
与2-甲基吡啶类似物29相比,D环为2-甲基噻唑31的hERG得到改善(IC50=24μM,表3),说明降低该类化合物亲脂性(ΔlogD7.4=-0.3)有利于改善hERG毒性。与化合物31(logD7.4=3.1),噻唑类似物化合物33(logD7.4=2.9)和37(logD7.4=2.9),也表现出改善hERG 安全性(IC50≥17μM)与降低亲脂性趋势一致(表3)。然而,...
生物活性:Lipoic acid ((R)-(+)-α-Lipoic acid) 是一种抗氧化剂,是线粒体酶复合物的重要辅助因子。 (R)-(+)-α-硫辛酸比外消旋硫辛酸更有效。 IC50 和目标:线粒体[1] 体外:硫辛酸 ((R)-(+)-α-硫辛酸) 是人体生物合成的形式,对有氧代谢至关重要。硫辛酸 ((R)-(+)-α-硫辛酸) 是营养和治疗...
读入药物的IC50数据: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 GDSC2_Res=readRDS(file=file.path(dir,"GDSC2_Res.rds"))dim(GDSC2_Res)head(GDSC2_Res)[,1:4] 列名是药物名称,只不过加了一个编号。行名就是细胞。 代码语言:javascript ...
简单来说,使用的表达矩阵是芯片数据,训练集和测试集分别进行quantile-normalization, 去除方差低的基因,用每个基因作为预测变量,药物的IC50作为结果变量拟合岭回归,然后使用拟合好的模型对新的数据进行预测。 安装 这个R包非常古老,虽然文章里说会不断更新,但是很明显没有更新过。 需要首先安装依赖包,然后通过以下链接下...
GDSC2_Res是每个细胞系对每个药物的IC50值,行是细胞系,列是药物,一共805种细胞系,198个药物。 再看下CTRP的数据,以TPM为例: CTRP2_Expr <- readRDS(file="../000files/DataFiles/Training Data/CTRP2_Expr (TPM, not log transformed).rds") CTRP2_Res <- readRDS(file = "../000files/DataFiles/...
根据这些SAR结果,可以推测环A和环D周围的受体结合口袋可以容纳额外的π-π或疏水相互作用。尽管非常有效,但是化合物3的LLE显著降低(ΔLLE=-0.55,3vs5)。且采用摇瓶法测试化合物3的溶解度较差(化合物3的溶解度0.4μM vs化合物5的溶解度≥200μM),低于标准的CYP谱2D6、2C9、2C19亚型的 IC50<10μM),有...
Selegiline (Deprenyl) hydrochloride 是一种有效、选择性和不可逆的 MAO-B 抑制剂,IC50 值为 51 nM。Selegiline hydrochloride 对 MAO-B 的选择性比 MAO-A 高 450 倍 (IC50=23 μM)。Selegiline hydrochloride 可用于帕金森氏病、阿尔茨海默病和重度抑郁症的研究。