ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len,color=dose)) +geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=7,outlier.size=4)+scale_color_manual(values=c("#999999","#E69F00","#56B4E9"))+theme(legend.position="right")+labs(title="Plot of length per dose",x="Dose (mg)", y ="Lengt...
ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area() # change fill color and alpha ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area(colour = "black",fill = "blue",alpha = .2) 然后我们看一下数据内有分组情况下的作图 library(ggplot2) #read in data data = read.table("area_plot2.t...
本文用clusterProfiler包KEGG信号通路富集分析,分别用enrichplot、ggplot2、pathview包绘制相关的图(柱状图、点状图、热图、网络图、通路图) 1用DOSE包里的基因list为例 library("DOSE") data(geneList, package = "DOSE") g_list <- names(geneList)[1:100] head(g_list) [1] "4312" "8318" "10874" "5...
ggplot(data=Arthritis, mapping=aes(x=Improved,fill=Sex))+geom_bar(stat="count",width=0.5,position='fill')+scale_fill_manual(values=c('#999999','#E69F00'))+geom_text(stat='count',aes(label=..count..), color="white", size=3.5,position=position_fill(0.5))+theme_minimal() 该模式最...
geom_boxplot() + theme_bw() p4 从上图可以看出,FT 组的体重改变量要高于其他两组,但是差异的显著性需要经过统计学检验才能得出结论。 ggpubr 包提供了在平行箱线图上添加组间比较的统计学差异的功能。该包是一个 ggplot2 的衍生包,可以生成用于论文发表的统计图形,值得医学研究工作者探索。下面在上图的基...
在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制qq图和boxplot图。 首先,需要安装ggplot2包,并加载该包: install.packages("ggplot2") library(ggplot2) 复制代码 接下来,可以使用ggplot()函数创建一个基础图形对象,并使用geom_qq()函数来绘制qq图: ggplot(data, aes(sample = variable)) + geom_qq() 复制代码 其中,...
使用ggplot创建基本图层，设置条形图的填充颜色，并绘制带误差线的条图：{r} p <- ggplot(data, aes(x = lable, y = mean, fill = group)) + scale_fill_manual(values=c("#F0E442", "#D55E00")) + geom_bar(stat = "identity", color="black", width = 0.55, position = ...
二、ggplot2包介绍 语法:每一个函数修改属于自己的部分,函数与函数之间用(+)号函数串联 示例: library(ggplot2) ggplot(data = mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) + # 指定数据集(mtcars)与变量(wt,mpg),aes()函数(aesthetic,美观)指定每个变量的角色
Bar,显著性标记,数据点 第一张柱状图 含Bar ,显著性标记 数据含有均值,方差和重复数,用于显著性判断和标记 代码如下: library(ggplot2)library(ggsignif)# Graphpad风格 绘图 柱状图# 去掉右上边框,坐标轴贴紧,上部多留10%空间,或者根据Y轴最大值调整# 刻度线,轴文本,轴标题,字体改为Arial 或者 serif# 轴标...