本文用clusterProfiler包KEGG信号通路富集分析,分别用enrichplot、ggplot2、pathview包绘制相关的图(柱状图、点状图、热图、网络图、通路图) 1用DOSE包里的基因list为例 library("DOSE") data(geneList, package = "DOSE") g_list <- names(geneList)[1:100] head(g_list) [1] "4312" "8318" "10874" "5...
ggplot(df, aes(x = Year, y = Rate, group = Group, color = Group)) + 指定数据集、X轴、Y轴以及分组变量geom_errorbar(aes(ymin = lower, ymax = upper), width = 0.1, size = 1.2) #绘制误差线,width是调节上下限宽度的,就是那个'I'上面的横横的长度,0就是一条竖线geom_text(aes(y = ...
library(ggplot2) library(stringr) library(ggprism) x_level<-paste(df$Group1,df$Group2,sep="_") x_level df1$group<-str_sub(df1$new_col,5,7) df1$new_col<-factor(df1$new_col, levels = x_level) ggplot(df1,aes(x=new_col,y=value))+ stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.2)...
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len,color=dose)) +geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=7,outlier.size=4)+scale_color_manual(values=c("#999999","#E69F00","#56B4E9"))+theme(legend.position="right")+labs(title="Plot of length per dose",x="Dose (mg)", y ="Lengt...
scale_fill_manual() #forbox plot, bar plot, violin plot, etc scale_color_manual() #forlines and points 以下代码设置箱线图的前景色: ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len,color=dose)) +geom_boxplot()+scale_color_manual(values=c("#999999","#E69F00","#56B4E9")) ...
bar plot r语言 r语言barplot设置图例 library(ggplot2) sunspotyear = read.table("area_plot.txt",sep = "\t",header = T) ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area() # change fill color and alpha ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area(colour = "black",fill = "...
在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制qq图和boxplot图。 首先,需要安装ggplot2包,并加载该包: install.packages("ggplot2") library(ggplot2) 复制代码 接下来,可以使用ggplot()函数创建一个基础图形对象,并使用geom_qq()函数来绘制qq图: ggplot(data, aes(sample = variable)) + geom_qq() 复制代码 其中,...
ggplot2作图X轴默认坐标轴的刻度是朝下的,Y轴默认的刻度是朝左的,如果要改为朝上和朝右,该如何设置。之前也有人问过这个问题 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 library(ggplot2)library(ggstar)ggplot()+geom_star(aes(x=1,y=1),size=100,starshape=16,fill="red")+theme_bw()+the...
二、ggplot2包介绍 语法:每一个函数修改属于自己的部分,函数与函数之间用(+)号函数串联 示例: library(ggplot2) ggplot(data = mtcars,aes(x=wt,y=mpg)) + # 指定数据集(mtcars)与变量(wt,mpg),aes()函数(aesthetic,美观)指定每个变量的角色