ggplot(df, aes(x = Year, y = Rate, group = Group, color = Group)) + 指定数据集、X轴、Y轴以及分组变量geom_errorbar(aes(ymin = lower, ymax = upper), width = 0.1, size = 1.2) #绘制误差线,width是调节上下限宽度的,就是那个'I'上面的横横的长度,0就是一条竖线geom_text(aes(y = ...
书接上回: R语言clusterProfiler包GO富集分析(enrichplot包、GOplot包和ggplot2绘图)通过某些方法(如差异基因、相关基因等)获得一批基因后,可以进行功能富集分析(包括GO和KEGG富集分析),以了解这些基因的…
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len,color=dose)) +geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=7,outlier.size=4)+scale_color_manual(values=c("#999999","#E69F00","#56B4E9"))+theme(legend.position="right")+labs(title="Plot of length per dose",x="Dose (mg)", y ="Lengt...
ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area() # change fill color and alpha ggplot(sunspotyear,aes(Year,Sunspots)) + geom_area(colour = "black",fill = "blue",alpha = .2) 然后我们看一下数据内有分组情况下的作图 library(ggplot2) #read in data data = read.table("area_plot2.t...
scale_fill_manual() #forbox plot, bar plot, violin plot, etc scale_color_manual() #forlines and points 以下代码设置箱线图的前景色: ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len,color=dose)) +geom_boxplot()+scale_color_manual(values=c("#999999","#E69F00","#56B4E9")) ...
library(ggplot2) library(stringr) library(ggprism) x_level<-paste(df$Group1,df$Group2,sep="_") x_level df1$group<-str_sub(df1$new_col,5,7) df1$new_col<-factor(df1$new_col, levels = x_level) ggplot(df1,aes(x=new_col,y=value))+ stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.2)...
ggplot2 包提供了一套基于图层语法的绘图系统,它弥补了 R 基础绘图系统里的函数缺乏一致性的缺点,将 R 的绘图功能提升到了一个全新的境界。ggplot2 中各种数据可视化的基本原则完全一致,它将数学空间映射到图形元素空间。想象有一张空白的画布,在画布上我们需要定义可视化的数据(data),以及数据变量到图形属性的映射...
在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制qq图和boxplot图。 首先,需要安装ggplot2包,并加载该包: install.packages("ggplot2") library(ggplot2) 复制代码 接下来,可以使用ggplot()函数创建一个基础图形对象,并使用geom_qq()函数来绘制qq图: ggplot(data, aes(sample = variable)) + geom_qq() 复制代码 其中,...
函数geom_errorbar()可以用来生成误差棒: library(ggplot2) # Default bar plot p<- ggplot(df2, aes(x=dose, y=len, fill=supp)) + geom_bar(stat="identity", color="black", position=position_dodge()) + geom_errorbar(aes(ymin=len-sd, ymax=len+sd), width=.2, position=position_dodge(...