使用glue expression 自定义标签: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 p +stat_pvalue_manual(stat.test, label = "T-test, p = {p}", y.position = 36) image 分组数据:在按照「dose」分组后比较 supp 水平: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 # Statistical test ...
WGCNA(Weighted GeneCo-Expression Network Analysis,加权共表达网络分析)分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。我们今天介绍下在R语言如何实现WGCNA,此包还有一个限制那就是样本总数必须大于15。 首先需要安装WGCNA包:首先需要先通过bioconductor安装相...
这个R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y轴刻度。同样,该文包含如何执行轴转换(对数化,开方等)和日期转换。 准备数据 使用ToothGrowth: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 # Convert dose column dose from a numeric to a factor variable ToothGrowth$dose<-as.factor(ToothGrowth$dose)head...
Li, Yumei, Xinzhou Ge, Fanglue Peng, Wei Li, and Jingyi Jessica Li. “Exaggerated False Positives by Popular Differential Expression Methods When Analyzing Human Population Samples.” 那么,既然我们有了p值自然就想要得到FDR以及logFC,因为只有...
variable[condition] <- expression 该语句仅在condition的值为TRUE时,执行赋值操作: mydata$x1[ mydata$x1<3]<-1 也可以使用更为紧凑的写法 mydata<-within(mydata,{x1[x1<3]<-1}) 注意:逻辑运算符等号是== 三,变量的重命名 查看数据框的变量名,函数names(df)返回变量名的向量: ...
“Exaggerated False Positives by Popular Differential Expression Methods When Analyzing Human Population Samples.” 那么,既然我们有了p值自然就想要得到FDR以及logFC,因为只有拥有了这些数据,我们才好在针对每个样本分组大于8的时候使用秩和检验来替代DESeq以及edgeR包 #修改并展示整体流程 wilcox_data <- data....
语句variable【condition】<- expression,仅在conditio的值为TRUE时执行即 变量【条件】<- 表达式 第二步创建agecat变量 leadership$agecat[leadership$age> 75] <- "Elder" leadership$agecat[leadership$age>= 55& leadership$age<=75 ] <-"Middle Aged" leadership$agecat[leadership$age <55] <- "Young"...
It is straightforward to use the placeholder several times in a right-hand side expression. However, when the placeholder only appears in a nested expressions magrittr will still apply the first-argument rule. The reason is that in most cases this results more clean code. ...
## Gene expression normalization and re-annotation (arrays: FALSE) ## Removing 17 noisy genes ## Removing 15 genes with high expression in tumors ## Signature genes found in data set: 134/138 (97.1%) ## Mixture deconvolution (method: lsei) ...
配置集合元素,集合元素为aa:bb:cc,如“100:1:1”,元素之间用“,”隔开;也可以使用regular regular-expression格式,表示路由的Large-community属性符合指定正则表达式,regular-expression为正则表达式。 正则表达式匹配是CPU运算密集型处理。当XPL策略中配置了大量的正则表达式对BGP路由属性进行匹配且对应的BGP路由属性长度较...