三、使用geom_label_repel函数 这里我直接将代码中的geom_text函数改为geom_label_repel函数: ggplot( data=muy,aes(x=day, y= MOI,color=year)) + scale_size(range = c(2, 20), name="legend") + geom_point(data=muy,aes( alpha=0.7,size = MOI)) + scale_color_viridis(discrete=T,option =...
ggplot(mtcars)+ geom_point(aes(wt, mpg), color="red")+geom_text(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))+theme_classic(base_size = 16) 可以看到可视化效果不是很好。接下来看看包ggrepel的效果。 geom_text_repel()是基于geom_text() library(ggrepel) set.seed(42) ggplot(mtcars)+ geom_point...
ggplot2绘图系统——扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载。 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线。 library(ggrepel) ggplot(mtcars,aes(wt,mpg))+geom_point(color='...
R语言是一种广泛应用于数据分析和可视化的编程语言。在R中,可视化是一个重要的组成部分,可以帮助我们更好地理解数据。geom_text_repel是R中一个非常有用的函数,可以用于在图形中添加文本标签,并通过自动调整标签的位置,避免标签之间的重叠。在本文中,我们将介绍如何使用geom_text_repel函数,并将其文本标签的字体样式...
murders%>%ggplot()+geom_point(aes(population/10^6,total))+geom_text(aes(population/10^6,total,label=abb),nudge_x=1.5)#正数表示向右平移 🌼6.7 全局和局部美学映射 上述我们使用了两次aes(population/10^6, total),在每一个几何对象中都使用了。我们可以通过设置全局映射来实现代码的简化 ...
geom_text_repel(data = result[which(result$Row.names %in% label_geneset),], aes( x = log2FoldChange, y = -log10(padj),label = Row.names),fontface = "italic")+ theme_bw()+ geom_vline(xintercept = c(-logFC,logFC),lty = 2)+ ...
可以看到可视化效果不是很好。接下来看看包ggrepel的效果。 geom_text_repel()是基于geom_text() library(ggrepel)set.seed(42)ggplot(mtcars)+geom_point(aes(wt,mpg),color="red")+geom_text_repel(aes(wt,mpg,label=rownames(mtcars)))+theme_classic(base_size=16) ...
可以看到可视化效果不是很好。接下来看看包ggrepel的效果。 geom_text_repel()是基于geom_text() library(ggrepel) set.seed(42) ggplot(mtcars)+ geom_point(aes(wt, mpg), color="red")+ geom_text_repel(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))+ ...
(NULL) + theme_bw() + theme(panel.grid.major = element_blank()) + theme(legend.key=element_blank()) + theme(axis.text.x=element_text(angle=45,hjust=1, vjust=1)) + theme(legend.position="top") + geom_tile(aes(fill=value)) + scale_fill_gradient(low = "white", high = "red...
pdf(file = "output.pdf", width = 10, height = 8, family = "serif") plota = ggplot(data = df, aes(x=V5, y=V6)) + geom_point(aes(color=V3, shape=V3),size=4)+ geom_text_repel(aes(label=V2),size=4) + scale_x_continuous(name = "mean rate of Missense / Slient") + sca...