这里我直接将代码中的geom_text函数改为geom_label_repel函数：ggplot( data=muy,aes(x=day, y= MOI...
ggrepel包提供了几个主要的函数,包括geom_text_repel()和geom_label_repel(),它们可以在ggplot2中使用。这些函数可以根据标签的位置和方向,自动调整标签的位置,以避免重叠。你可以通过调整参数来控制标签的位置和方向,以满足你的需求。 ggrepel包的优势在于它可以自动处理标签重叠问题,使得图表更加清晰和易读。它适用...
我懒得查函数,直接用excel做了,故这部分代码省略。 library(ggplot2) library(ggrepel) temp<-test[which(test$X=="intersect"),] library(Cairo) CairoJPEG("crosstalk.jpeg",width=7200,height=4800,res=1200) ggplot(test)+geom_point(aes(x=test$Symbol,y=test$log2FoldChange.C2.C1.,colour=factor(...
该包的具体介绍大家可以去官网查看,主要包含geom_label_repel和geom_text_repel函数,以geom_text_repel函数为例,用法如下: geom_text_repel( mapping = NULL, data = NULL, stat = "identity", position = "identity", parse = FALSE, ..., box.padding = 0.25, point.padding = 1e-06, min.segment.l...
theme(axis.text.x=element_blank()) 去掉X轴刻度尺 theme(axis.ticks.x = element_blank()) 去掉X轴标题 theme(axis.title.x = element_blank()) 在图上加基因名字(我只想给重叠的基因加,不然太乱了) geom_text_repel(aes(x=test$Symbol,y=test$log2FoldChange.C2.C1.,label=ifelse(test$X=="...
geom_bar() + scale_fill_brewer(palette = "Dark2") .7 添加文字标注 ggrepel包提供了geom_label_repel()函数或者geom_text_repel()函数,为图形添加文字标注。 操作步骤: 第一步:先准备好标记点的数据 第二步:增加文字标注图层,包括标记点的数据和标注的文字给label参数 ...
(0, 0) ) +# 添加高亮点geom_point(data=subset(data, is_highlight=="yes"), color="orange", size=2) +# 添加高亮label,且防止重叠geom_label_repel( data=subset(data, is_annotate=="yes"), aes(label=SNP), size=2) +theme_bw() +theme(legend.position="none",panel.border = element_...
theme(axis.text.x=element_blank()) 去掉X轴刻度尺 theme(axis.ticks.x = element_blank()) 去掉X轴标题 theme(axis.title.x = element_blank()) 在图上加基因名字(我只想给重叠的基因加,不然太乱了) geom_text_repel(aes(x=test$Symbol,y=test$log2FoldChange.C2.C1.,label=ifelse(test$X=="...
p=identical(rownames(pd),colnames(exp));p #输出结果是TRUE就不需要调整if(!p)exp=exp[,match(rownames(pd),colnames(exp))]#用match函数根据pd的行名来调整exp的列名 image.png #(4)提取芯片平台编号gpl<-eSet[[1]]@annotationgpl1<-eSet[[2]]@annotation ...
geom_point(aes(color=as.factor(CHR))) 基本图形出来了,但是有点怪;不急,一点点改进: 横坐标标签设置在每个chr中间位置; 背景色去掉,线去掉等 去掉点和X轴之间的 “gap” (很多地方可用) 添加阈值线 2 绘制加强版Manhattan图 1) 准备X轴标签位置--在每条chr的中间 ...