相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并用不同的R包展示。load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyverse...
rou1 = r, col = "white", border = "black") draw.sector(center = c(0, r/2), start.degree = 0, end.degree = 360, rou1 = r/2, col = "white", border = "white") draw.sector(center = c(0, -r/2), start.degree = 0, end.degree = 360, rou1 = r/2, col = "black"...
R绘图:相关性分析与作图 今天我们来讲一下,单基因之间相关性分析及作图,这个在实验性文章中用到得更广泛 首先还是加载数据,数据来源于TCGA数据下载与ID转换 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(...
首先还是加载数据,数据来源于R绘图:相关性分析与作图 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(mRNAdata))dat<-log2(dat+1) 我们用LDHA和PKM来示范绘图,方法选择pearson,显示平均值 ggscatterstats(dat, ...
r语言相关性作图_R绘图:相关性分析与作图.pdf,r语⾔相关性作图_R绘图:相关性分析与作图 热图系列1 R语⾔学习系列之“多变的热图” TCGA数据分析系列之⽕⼭图 R绘图 ggpubr: 为学术⽽⽣ R绘图 ggsci: ⾼⼤上的论⽂配⾊,⼀⽂解决配⾊问题 相关性
R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并...
R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并...