R统计绘图-PCA分析绘图及结果解读(误差线,多边形,双Y轴图、球形检验、KMO和变量筛选等) EcoEvoPhylo R语言快速画出ROC曲线和算出可信区间和p值 笑不语 R语言统计与绘图:快速绘制临床论文基线特征表1 1. 前言怎么快速绘制绘制临床论文中的基线特征 表1?需要用到 tableone包。 tableone包是用来创建“表1”(也就...
相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能，单基因的批量相关性分析，可以用于做单基因的GO，KEGG富集分析和GSEA分析，也有多基因之间的相关性分析，或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据，挑选一些基因做相关性分析，并用不同的R包展示。load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyverse...
R绘图：相关性分析与作图 今天我们来讲一下，单基因之间相关性分析及作图，这个在实验性文章中用到得更广泛 首先还是加载数据，数据来源于TCGA数据下载与ID转换 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置，并转换成数据框，取log dat<-as.data.frame(t(...
今天我们来讲一下,单基因之间得相关性分析及作图,这个在实验性得文章中用到得更广泛 首先还是加载数据,数据来源于TCGA数据下载与ID转换 rm(list=ls()) library(ggstatsplot)#加载包 load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(mRNAdata)) dat<-log2(...
R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并...
首先还是加载数据,数据来源于R绘图:相关性分析与作图 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(mRNAdata))dat<-log2(dat+1) 我们用LDHA和PKM来示范绘图,方法选择pearson,显示平均值 ggscatterstats(dat, ...
R绘图:相关性分析与作图 今天我们来讲一下,单基因之间得相关性分析及作图,这个在实验性得文章中用到得更广泛 首先还是加载数据,数据来源于TCGA数据下载与ID转换 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log ...
R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并...