cor_new<-cor(new)#计算相关性系数cor_new corrplot包画图 method：指定形状，可以是circle圆形(默认)，square方形，ellipse,椭圆形，number数值，shade阴影，color颜色，pie饼图。type：指定显示范围，full完全(默认)，lower下三角，upper上三角 corrplot(cor_new, method = "circle")corrplot(cor_new, method = "...
R绘图：相关性分析与作图 今天我们来讲一下，单基因之间相关性分析及作图，这个在实验性文章中用到得更广泛 首先还是加载数据，数据来源于TCGA数据下载与ID转换 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置，并转换成数据框，取log dat<-as.data.frame(t(...
首先还是加载数据,数据来源于R绘图:相关性分析与作图 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file = "mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(mRNAdata))dat<-log2(dat+1) 我们用LDHA和PKM来示范绘图,方法选择pearson,显示平均值 ggscatterstats(dat, ...
热图系列1 R语言学习系列之“多变的热图” TCGA数据分析系列之火山图 R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性…
TCGA数据分析系列之火山图 R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑...
r语言相关性作图_R绘图:相关性分析与作图.pdf,r语⾔相关性作图_R绘图:相关性分析与作图 热图系列1 R语⾔学习系列之“多变的热图” TCGA数据分析系列之⽕⼭图 R绘图 ggpubr: 为学术⽽⽣ R绘图 ggsci: ⾼⼤上的论⽂配⾊,⼀⽂解决配⾊问题 相关性
TCGA数据分析系列之火山图 R绘图 ggpubr: 为学术而生 R绘图 ggsci: 高大上的论文配色,一文解决配色问题 相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑...
首先还是加载数据,数据来源于R绘图:相关性分析与作图 rm(list=ls())library(ggstatsplot)#加载包load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据 将数据转置,并转换成数据框,取log dat<-as.data.frame(t(mRNAdata))dat<-log2(dat+1) 我们用LDHA和PKM来示范绘图,方法选择pearson,显示平均值 ...