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PCR是在研究和诊断中检测DNA存在的灵敏方法。PCR中使用的聚合酶经常被大肠杆菌 DNA 污染 。当靶向少量细菌DNA时,污染的DNA可能会导致灵敏度降低和假阳性。其他污染源可能是dNTP,缓冲液成分和引物/探针,以及在处理过程中引入的DNA。细菌的检测和分型可以通过使用针对保守区域(即16S或23S rDNA基因)的宽范围引物进行。