importpydicom# 读取DICOM文件dcm_file_path='path/to/your/file.dcm'dcm_data=pydicom.dcmread(dcm_file_path)# 打印文件中的元数据print("患者姓名:",dcm_data.PatientName)print("患者ID:",dcm_data.PatientID)print("图像标注:",dcm_data.get('RegionOfInterest','无标注')) 1. 2. 3. 4. 5. 6...
要将DICOM文件转换为NIfTI(.nii)文件,你可以使用Python中的几个库来完成这一任务。以下是一个详细的步骤指南,包括所需的库、代码示例以及验证步骤: 1. 查找并安装适当的Python库 你需要安装pydicom库来读取DICOM文件,以及nibabel库来写入NIfTI文件。如果希望使用更高级的功能,如批量处理,还可以考虑使用dicom2nifti或Si...
files=os.listdir(data_path+'T1_MPRAGE_SAG_1_0ISO_IPAT2_0003/')#Get file list in this folderdata=[]data_all=[]forfileinfiles:data=pydicom.dcmread(data_path+'T1_MPRAGE_SAG_1_0ISO_IPAT2_0003/'+file)data_all.append(data.pixel_array)#Convert list to arrayt1_all=np.array(data_all...
dcm2niix 1.0.20181114 h6bb024c_1000 conda-forge decorator 4.4.2 py_0 - defusedxml 0.6.0 py_0 - docutils 0.16 py36_1 - dropbox 10.2.0 py36_0 - entrypoints 0.3 py36_0 - expat 2.2.9 he6710b0_2 - filechunkio 1.6 py36_0 bioconda filelock 3.0.12 py_0 - fontconfig...
smtp协议即简单邮件传输协议,而在Python的smtplib库里对smtp协议进行了封装,对于用户很友好,关于smtplib库的详细介绍可以看官方的文档。 2. QQ邮箱授权码的获取 登陆网页版QQ邮箱,在帐户那里可以开启QQ邮箱的服务,然后点击授权码,在输入QQ安全中心(手机令牌)显示的动态密码,这样子就可以生成QQ邮箱的授权码了。
有一个库叫做simpleitk，他提供函数可以直接读入nii文件然后可以存成dcm的格式。例如：img=sitk.ReadImge(”aa.nii”);sitk.WriteImge(img,filename);
可以使用Python的dicom依赖包来读取dicom数据dicom.read_file(‘a.dcm’) 1.2 mhd格式 每个病人一个mhd文件和一个同名的raw文件的格式,mhd即meta header...mhd文件需要借助python的SimpleITK包来处理。...import Simple ITK as sitk itk_img = sitk.ReadImage(‘a.mhd’) img_array = sitk.GetArrayFromImage(...
df2.to_numpy() array([[1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'test', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'train', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'test', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:...
df2.to_numpy() array([[1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'test', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'train', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:00:00'), 1.0, 3, 'test', 'foo'], [1.0, Timestamp('2013-01-02 00:...
PythonDCM转JPG转NRRD转NII方法本文将介绍以下文件格式间的转换 DCM→JPG JPG→DCM DCM→NRRDNRRD→NIIDCM文件是一种医学影像文件,除了文件信息,还包含影像数据,即图像信息,只要能够提取到这个图像信息,就可以将其转换为如JPG等图片格式。 在医学影像处理中,常用到MASK掩膜,即勾画病灶区域,以进行病理分析预测,将DCM文...