CellPhoneDB单细胞互作分析（3）：结果可视化作图 CellPhoneDB单细胞互作分析（4）：受配体对结果提取及可...
一、需要输出日志的关键位置 1.1 关键业务逻辑执行的场景 当你的核心业务逻辑执行时，我们需要进行日志的输出，例如以下几个场景：用户订单创建用户支付用户取消订单用户注册其他 像这样的场景是用户操作的关键点，必须要作为输出内容。示例代码 # cellphone 做敏感化处理logger.info(f'用户 {user_id} 注册成功，手机...
pip install cellphonedb -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com 二、数据文件准备 一些分析用的依赖数据库及文件: #TF注释 #鼠的 wget https://resources.aertslab.org/cistarget/motif2tf/motifs-v9-nr.mgi-m0.001-o0.0.tbl #人的 wget https://resources.aertslab.org/ci...
pySCENIC则很好的解决了这个问题,分析速度很快。官方教程参考: https://pyscenic.readthedocs.io/en/latest/ 一、软件安装 老样子,还是先说一下安装和分析文件的准备,前面环境的配置和之前cellphonedb一样,如果已经操作过的,可以跳过: #安装下载及环境设置 # 安装一个conda,为什么安装他可以理解为Rstuido之于R,后期...
as well, as github repositories. Also leave a star at thektplotspyand the originalktplotsrepositories! About Python library for plotting Cellphonedb results. Ported from ktplots R package. ktplotspy.readthedocs.io/ Resources Readme License ...
然后作者进行对不同的细胞亚类和不同进程的病人评估了hazard ratio。找到了与存活率有关的因素。 这一部分需要结合上面生存分析的继续研读。 接着作者做了细胞间通讯,主要使用软件cellphoneDB.
例如,您可能有一个充满客户记录的电子表格,并希望根据每个客户的年龄和位置信息向他们发送不同的套用信函。商业软件可能无法为你做到这一点;幸运的是,您可以编写自己的程序来发送这些电子邮件,从而节省大量复制和粘贴表单电子邮件的时间。 你也可以编写程序,发送电子邮件和短信通知你,即使你不在电脑旁。如果你正在自动化...
db.items.insert(item) 需要注意的是,上面的get_price和get_item函数分别从两个url获取数据,这是因为配置信息可以直接从商品页面中解析得到,而价格信息需要从另外一个ajax请求里获得。爬下来的所有数据存入MongoDB。 过滤数据 爬下来的手机数据当中,信息完整的共有4700多条数据,这4700多部手机属于70个手机品牌。 这...
sql = u"SELECT * from TABLE_NAME where cellphone = '%s'" % ('15411111111') #使用cursor()方法创建一个游标对象 conn = db.cursor() try: #使用execute方法执行sql conn.execute(sql1) results = conn.fetchone() print(results) except Exception: ...
我们做单细胞转录组数据分析的时候尤其是喜欢使用这个函数,比如我们的多个样品整合后细分到亚群,然后在R的gplots包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果如下所示: