15号和16号字体是unicode的:Pymol set label_font_id, 5字体大小,假如为 45、正值,则单位就是正常的px。你也可以用负值,则单位是:Pymol set label_size, -0.5Pymol set label_size, 4设置label位置,用下列命令可以设置label离默认位置的三维偏移值,在需要给spheres加标签的时候有用:Pymol set label_...
15号和16号字体是unicode的: pymol set label 29、_font_id, 5 字体大小,如果为正值,则单位就是正常的px。你也可以用负值,则单位是: pymol set label_size, -0.5pymol set label_size, 4 设置label位置,用下列命令可以设置label离默认位置的三维偏移值,在需要给spheres加标签的时候有用: pymol set ...
set dash_gap, 0.5set dash_radius, 0.1before the ‘ray’ command.Gareth Stockwell· Adjusting size of selection indicatorsAdjusting size of selection indicatorsTry:set selection_width, 6set selection_width, 7Warren L. DeLanoAdjusting ray trace-image sizeThe pymol ray tracer can generate an image ...
Setting/label/size 18调节字体的大小 Setting/edit all cartoon的颜色改回白色(在filter里输cartoon可以快点找出来,改完后按回车) //或者输入命令Pymol>set cartoon_color white 在改氢键的线型,在dash gap length width进行调整把虚线改好看点 Stick也可以改细点 13.电子密度 1)首先,登陆搜索你的蛋白 2)downloa...
set label_size,28 设置字体大小 set stick_radius=0.10设置sticks的粗细 set sphere_scale,0.28 设置原子大小 如何除去cartoon上的绿色部分? 首先选择这个残基,然后hide main chain ,再调为atom模式,选择backbone上的CA原子,选择color灰色,就可以了。 显示氢键 ...
{pdb_name}', 'oneletter+resi') cmd.set('label_bg_color', -7, '', 0) cmd.set('label_size', 14, '', 0) cmd.set('label_font_id', '18') cmd.select('neighbor_res', neighbor_res) cmd.show('sticks', neighbor_res) cmd.set('stick_radius', '0.1', pdb_name) cmd.select('...
通过set命令可以更改下载源,例如set fetch_host,pdb。其中pdb数据库有两个镜像库,分别是欧洲的pdbe和日本的pdbj。 如果想下载PDB文件,则可通过type进行声明 PyMOL>fetch 4hkb,type=pdb HEADER IMMUNE SYSTEM 15-OCT-12 4HKB TITLE CH67 FAB (UNBOUND) FROM THE CH65-67 LINEAGE ...
Pymol> set label_size, 4 位置，⽤下列命令可以设置label离默认位置的三维偏移值，在需要给spheres加标签的时候有⽤：设置label位置 Pymol> set label_position, (x,y,z)最后说说怎样⽤单个字母标注氨基酸 ⽤单个字母标注氨基酸。⾸先在$HOME/.pymolrc中加⼊：# start $HOME/.pymolrc modification ...
Pymol> set label_outline_color, [color-name, [selection]] 字体,pymol内置了12种字体,编号从5-16。15号和16号字体是unicode的: Pymol> set label_font_id, 5 字体大小,如果为正值,则单位就是正常的px。你也可以用负值,则单位是Å: Pymol> set label_size, -0.5 ...
Set control (可以通过这个命令来调整所有参数的值,可惜没有什么详细的介绍) 例如setsphere_scale, 0.5, (n. Fe) #decrease Fe atom size to 0.5 setbg_rgb, [1,1,1] #set background as white setribbon_sampling, 1 Measurement (又一个十分重要的功能,可以真正挖掘结构的意义) dist#测量两个原子之间...