将PyMOL的安装包复制到c盘根目录。接着，打开PowerShell窗口，并输入命令“python -m pip install c:\pymol-2.4.0-cp38-cp38-win_amd64.whl”。将PyMOL安装包放置于c盘根目录，通过命令安装，成功后系统提示确认。若安装顺利，将会看到“Successfully installed py
安装Python,并确保Python版本与你要安装的PyMOL版本兼容。 安装pip,pip是Python的包管理器,用于安装和管理外部库。 选择合适的whl文件: 根据你的Python版本和操作系统,从可靠的来源下载对应的PyMOL预编译whl文件。 安装步骤 下载whl文件: 访问可靠的源,如gitee.com/dirty-little-star/whl_chinese_mirror或其他可信...
Pymol学习笔记(一):软件安装 Pymol是一款用python编写的蛋白质高级结构分析软件。这个软件功能十分强大,可以对于pdb格式的蛋白质文件进行一些基本处理。可以模拟一些蛋白质和其他小分子的互作状态,可以测试蛋白质点突变之后对于整个结构的影响,还可以绘制一些需要的“概念图”用于组会汇报或者论文撰写。总之是一个十分有力...
Pymol是一款用于创作高品质分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构图像的软件。其名字的来源是“Py”,表示该软件基于python这个计算机语言,“Mol”则是英文分子(molecule)的缩写,表示该软件用来显示分子结…
勾选【Install Python 3.14 for all users】 修改路径(我本人习惯是D盘) 点击【Install】 安装结束点击【Close】 点击桌面任务栏中的【开始图标】找到python软件后,双击没问题即安装成功 第二步:Autodock、Vina、MGLTools、Pymol安装 Autodock下载网址:https://autodock.scripps.edu/ ...
Pymol的安装 从下面网址中选择安装包下载 https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol 在(在页面中搜索)搜索pymol即可快速定位 根据电脑的配置按需选择下载 在指令窗口默认路径中输入下载保存的pymol安装包所在盘符(我的是D:),回车 用cd 文件加名,进入pymol安装包所在文件夹(此为cd pymol(中间有空格...
pip install pymol-2.5.0-cp38-cp38-win_amd64.whl 1. 3. 验证安装 测试安装:打开Python交互式解释器或创建一个新的Python脚本来测试是否安装成功: import pymol print(pymol.__version__) 1. 2. 这应该会输出你安装的PyMOL版本号。 启动PyMOL:你也可以直接在命令行中启动PyMOL: ...
pymol的使用需要基于python环境,本教程从python环境配置开始,基于python2.7进行安装。如果您曾经安装过python,可以直接进入pymol安装步骤,但是要留意下载对应版本的whl文件。 本次使用到的文件:链接:https://pan.baidu.com/s/1aPQggII3HvvTM6X3j-wlhA 提取码:1234 ...
Python与Pymol成功下载安装的步骤记录如下：一、Python的安装 版本选择：选择Python 3.11.5版本，适用于64位Windows系统。下载与保存：访问python.org官网，找到Stable Releases部分的Python 3.11.5版本，点击下载。将下载的安装包保存至D:Moleculardockingpython文件夹。安装过程：双击安装包，选择“Add ...
Pymol的使用其实可以分为两种,一种是GUI图形操作界面,直接可以去Pymol官网上下,另一种则是使用API的方式直接调用,适合写脚本批量处理一些东西。建议画图,看结构直接用GUI,但是计算RMSD啥的,用API处理会非常顺滑。 今天主要介绍一下怎么使用anconda上下载安装pymol并且通过API命令行进行使用。 因为pymol的python支...