8.在Pull down实验之前,解冻准备好的细胞提取物。4°C, 17000 × g 离心20分钟。使用上清液作为猎物。 3.2以细胞裂解液为猎物的Pull down试验。 1.将120 μL Ni-NTA 琼脂糖珠转移到重力流柱上。 2. 4°C, 1000 × g离心 1 min。 3.向柱中加入400 μL蒸馏水。 4. 4°C, 1000 × g离心 1 min。
(3)体外转录:将步骤2中获得的PCR产物,用体外转录试剂盒进行体外转录实验以获得目标RNA(含 sense 及 Anti-sense 两组);在体外转录的过程中,主要由T7 RNA聚合酶将转录模板DNA转录成RNA;(4)RNA生物素标记:为了方便RNA-蛋白的富集,需要在RNA 3'端进行生物素标记或者标签标记,然后与链霉亲和素磁珠结合...
DNA pull-down实验首先针对靶标区域设计特异性DNA探针,探针经过脱硫生物素标记,跟偶联在磁珠上的链霉亲和素结合;细胞核提取物与磁珠-DNA探针孵育,作用蛋白质分子可以和DNA探针特异性结合;纯化出与靶DNA片段结合的蛋白复合体,经过洗涤可以将非特异性结合蛋白质去除;最后,经洗脱液洗脱,得到目的DNA探针-蛋白质复合物,再...
在摇床上室温摇动10 min,摇动速度为60-70 rpm。水洗涤:弃银染终止液,加入100 ml Milli-Q级纯水或双蒸水,在摇床上室温摇动2-5 min,摇动速度为60-70 rpm。保存:可在Milli-Q级纯水或双蒸水中保存。或采用适当的方式制备成干胶。十、实验结果 10.1 WB预实验验证抗体质量(WB项目-质控1)例如:结果说明...
pull-down 实验,即下拉实验,也称为体外蛋白结合实验,用以验证蛋白和蛋白间的互作关系,同时也可以某一蛋白为诱饵,钓取与诱饵蛋白存在相互作用的未知蛋白。 而小分子 pull-down则是在pull-down的基础上,通过化学合成的方法将活性小分子进行修饰,连接上报告分子(如生物素),制备成小分子探针,通过探针分子上的报告分子...
4️⃣ GST pull-down 验证与结果分析GST pull-down实验经过考马斯亮蓝和Western blot检测后即可进行结果分析。考马斯亮蓝检测:通过考染胶中纯化条带区别于未纯化样品条带的分布情况,可以明显看出纯化后的探针蛋白A,在实验组与对照组中都有分布;下面与蛋白A互作的未知蛋白在实验组中存在,在对照组中不存在,证明...
pull down 实验方法PullDown实验流程 1.混合两种预测相互作用的蛋白。(Protein-A-GST &Protein-B-HIS,下面实验用GST树脂IP,用WesternBlot检测HIS;反之亦然。如果是纯化后的蛋白,需要进行偷袭或者使用超滤离心管为蛋白更换溶液,之后才能继续PullDown。) 2.加入1 mL Binding Buffer。 Binding Buffer:50 mM Tris.HCl...
蛋白Pull Down实验通常包括以下步骤:1.制备亲和剂:选择适当的亲和剂,将其结合到固相材料上。常用的亲和剂包括抗体、蛋白质结合域和核酸结合域等。2.样品制备:将样品加入到亲和剂结合的固相材料中,使其与亲和剂结合。3.洗涤:用缓冲液洗涤固相材料,去除非特异性结合的蛋白质。4.富集:用洗涤缓冲液洗涤固相材料...
在pulldown实验中,DNA序列通常是作为配体固定在固相介质上,而蛋白质则是靶蛋白。通过将混合物与固相介质接触,靶蛋白与固相上的DNA结合,而其他非特异性结合的蛋白质则被洗脱掉。最终,只有与DNA特异性结合的蛋白质被富集下来。 二、实验步骤 1. 准备工作 a. 合成或克隆目标DNA序列,并将其连接到适当的表达载体上。
(2)蛋白质Pull-down的主要步骤 ①GST融合蛋白先与下列蛋白溶液之一孵育,包括:a.单一明确的重组蛋白;b.细胞裂解蛋白混合液;c.体外翻译cDNA表达得到的未知蛋白。 ②混合液与谷胱甘肽琼脂糖球珠在4℃反应2h,离心得沉淀。 ③沉淀加入Loading Buffer煮沸3min,高速离心,取上清液进行SDS-PAGE电泳。 ④考马斯亮蓝对SDS-PAG...