解析 PDB中收录了大量通过实验(X射线晶体衍射,核磁共振NMR)测定的生物大分子的三维结构,记录有原子坐标、配基的化学结构和晶体结构的描述等。PDB数据库的访问号由一个数字和三个字母组成(如,4HHB),同时支持关键词搜索,还可以FASTA程序进行搜索。反馈 收藏 ...
PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍. 对大多数用户而言, 了解这些内容就够了, 但对那些需要创建PDB...
蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要...
Protein Data Bank是一个用于存储和分享生物大分子结构数据的数据库。解释如下:Protein Data Bank简介 Protein Data Bank是生物化学领域极为重要的数据库,专门用于存储和分享生物大分子的结构数据。这些数据主要关于蛋白质、核酸和其他生物分子的三维结构信息。PDB为科研人员提供了一个平台,使他们能够了解...
PDB,即Protein Data Bank,是一个存放着众多生物大分子三维结构数据的重要资源库。这个数据库主要收录了通过精密实验手段如X射线晶体衍射和核磁共振NMR技术解析出的分子结构信息,包括原子的精确坐标、配基的化学结构细节以及晶体结构的详尽描述。每个数据项都有其独特的标识,通常由一个数字和三个字母组成,...
The website also proclaims that there have been 62987 structure hits and 11915 ligand hits on this date and that the PDB has 24583 citations.S ParasuramanMedknowJournal of Pharmacology and Pharmacotherapeutics
怎么使用PDB(proteindatabank)怎么使⽤PDB(proteindatabank)
This section provides a quick introduction of the PDB (Protein Data Bank), which is a database for the three-dimensional structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids.
It provides in-depth discussions of the structural and functional aspects of many proteins. Here we focus on the databases that are often used and are essential for the fields of structural biology and structural bioinformatics - the RSCB Protein Databank (PDB) and two European versions, PDBe ...