但是这样得到的仅有probe id,没有gene symbol, 那又该怎么样办呢? 我们可以下载平台的注释文件 下载好之后用excel打开进行排序匹配就可以了。 最终得到了这个具有gene symbol的矩阵 本次分享就到这里,感谢大家的阅读。本文来源于微信公众号SCI狂人,版权归SCI狂人团队所有。
是指将基因芯片或转录组测序中使用的探针ID(probe ID)转换为对应的基因符号(gene symbol)。探针ID是用于标识基因芯片上的探针或引物序列的唯一标识符,而基因符号是用于表示特定基因的符...
虽然这样可以做到,但是当需要查询的 probe_id 的数量多时便不适用了。 多个probe_id 的查询 如果想查询多个 probe_id 的话,应该有一个文本,里面有 probe_id 与 gene_id 等其他注释信息的一一对应关系。这样的文档可以在 Affymetrix 官网 中找到: Affymetrix Rice 里面有很多不同版本的信息,非常有用,个人认为比...
3. 使用在线的基因ID转换API服务,如MyGene.info提供的ID转换API,输入gene id信息和基因组版本或者物种信息,可以解析出对应的symbol信息。4. 在NCBI Gene数据库中批量查询gene id,该数据库中gene id对应的gene symbol信息较为完整,可以此获得转换信息。5. 如果是Affymetrix等芯片平台的探针id(probe id),...
probe ID number 探头编号 When this probe fires, you want to count the number of invocations and emit this count with an indication of the calling process ID ( PID).当该探针触发时，您希望计算调用的次数，并发送这个计数以及表示调用进程ID（PID）的信息。希望我的回答对你有帮助。
[,1],probe_name) #确定能匹配上的probe表达值 probe_exp<-probe_exp[loc,] #每个probeid应对的geneid raw_geneid<-as.numeric(as.matrix(probeid_geneid[,3])) 最后一步raw_geneid<-as.numeric(as.matrix(probeid_geneid[,3])) 软件显示 Error in `[.data.frame`(probeid_geneid, , 3) : ...
产品名称: Sampling Probe ID 0,15mm for ASX-100 产品型号: 产品展商: 其它品牌产品文档: 无相关文档 简单介绍 Sampling Probe ID 0,15mm for ASX-100Sampling Probe ID 0,15mm for ASX-100 的详细介绍 Description sample capillary OD 1/16\", ID 0,15mm (red), for 50µL/min sample uptake, ...
最近用R做一个表达矩阵的注释的时候,发现有2000多个探针对应了多个gene symbol ,以abc /// edf ///hda的形式出现,经过多番捣腾,也搞不出结果。现...
今天公众号：BioInfoCloud将从GEO芯片的原始数据进行分析，为大家详细的讲解。
Mapping Illumina ProbeID as nuIDPan Du