如果想查询多个 probe_id 的话,应该有一个文本,里面有 probe_id 与 gene_id 等其他注释信息的一一对应关系。这样的文档可以在 Affymetrix 官网 中找到: Affymetrix Rice 里面有很多不同版本的信息,非常有用,个人认为比较全面的是 "Rice Annotations, CSV format, Release 35 (10 MB, 10/7/14)" 这个文件,下...
但是这样得到的仅有probe id,没有gene symbol, 那又该怎么样办呢? 我们可以下载平台的注释文件 下载好之后用excel打开进行排序匹配就可以了。 最终得到了这个具有gene symbol的矩阵 本次分享就到这里,感谢大家的阅读。本文来源于微信公众号SCI狂人,版权归SCI狂人团队所有。
import pandas as pd # 加载注释文件 annotation = pd.read_csv('annotation.csv') # 加载包含probeID的数据 data = pd.read_csv('data.csv') # 将probeID转换为gene symbol data['gene_symbol'] = data['probeID'].map(annotation.set_index('probeID')['gene_symbol']) # 保存转换后的数据 data....
(probe_exp) #probe进行匹配 loc<-match(probeid_geneid[,1],probe_name) #确定能匹配上的probe表达值 probe_exp<-probe_exp[loc,] #每个probeid应对的geneid raw_geneid<-as.numeric(as.matrix(probeid_geneid[,3])) 最后一步raw_geneid<-as.numeric(as.matrix(probeid_geneid[,3])) 软件显示 ...
probeset ID是基因芯片上的探针序列的ID,gene symbol是基因的标准名称缩写。两者常常需要互相转换,具体方法如下:1. 使用Bioconductor的AnnotationDbi包。该包提供了许多基因芯片的注释信息,可以通过probe ID查询对应的gene symbol。例如,对于Affymetrix的HG-U133 Plus 2.0芯片,使用code如下:rlibrary(...
你好，很高兴为你解答，答案如下：probe ID number 探头编号 When this probe fires, you want to count the number of invocations and emit this count with an indication of the calling process ID ( PID).当该探针触发时，您希望计算调用的次数，并发送这个计数以及表示调用进程ID（PID）的信息...
Module Instance Base Address Register Address i_noc_ccu_ios_probe_ccu_main_Probe 0xFFD22400 0xFFD22400 Size: 32 Offset: 0x0 Access: RO Important: The value of a reserved bit must be maintained in ...
probe_soc2fpga_main_Probe_Id_RevisionId Fields BitNameDescriptionAccessReset 31:8 FLEXNOCID Field containing the build revision of the software used to generate the IP HDL code. RO 0x148 7:0 USERID Field containing a user defined value, not used anywhere inside the IP itself. RO 0x0 Con...
采集解析设备ID(ProbeID)由哪三部分组成()。 A.采集解析设备类型 B.采集解析设备本省编号 C.采集解析设备网络制式 D.采集解析设备所属厂家 查看答案
智力通 IEC61032 ProbeA图1试具A试验指探针ZLT-I01 更新时间:2024年07月01日 数智集采,工业好物狂欢趴!填写信息即可参与抽奖哦! 价格 ￥900.00 起订量 1个起批 货源所属商家已经过真实性核验 发货地 广东 广州 数量 获取底价 商家响应极速,可发送询盘 查看电话 在线咨询 QQ联系 ...