Key passphrase: 2017-09-14T21:45:58 prefetch.2.8.2 err: process failed while waiting process - ascp failed with 1 Key passphrase: 2017-09-14T21:46:03 prefetch.2.8.2 err: process failed while waiting process - ascp failed with 1 2017-09-14T21:46:03 prefetch.2.8.2: fasp download ...
prefetch--ascp-options"<options>" -use-ftp 此参数用于强制使用FTP下载测序数据。 使用示例: prefetch--use-ftp<accession_number> -https 此参数用于下载测序数据时使用HTTPS协议。 使用示例: prefetch--https<accession_number> -fasterq-dump-path 此参数用于指定fasterq-dump工具的路径,该工具用于快速将SRA格式转...
prefetch会自动调用aspera的ascp。 下载的速度还是很快的,一个文件一分钟左右: 虽然prefetch会自动调用ascp,但由于网速等原因,有时也会出现timeout,特别是大文件下载,出现类似process failed while waiting process - ascp failed with 1的错误,这时最好是指定ascp: prefetch-t ascp -a"/home/user/.aspera/connect/...
prefetch会自动调用aspera的ascp。 下载的速度还是很快的,一个文件一分钟左右: 虽然prefetch会自动调用ascp,但由于网速等原因,有时也会出现timeout,特别是大文件下载,出现类似process failed while waiting process - ascp failed with 1的错误,这时最好是指定ascp: prefetch -t ascp -a "/home/user...
prefetch-vSRR925811Maximum file size download limit is20,971,520KB2019-06-16T01:54:42prefetch.2.3.5:Using'ascp'2019-06-16T01:54:42prefetch.2.3.5:Using'/home/kelly/.aspera/connect/bin/ascp'20190654prefetch.err:error unexpectedwhileresolving tree within virtual file system module-failed to resol...
Version 6.2 (Build 9200: )</Os> <Ascp> ascp_locate = RC(rcNS,rcFile,rcCopying,rcFile,rcNotFound) <MaxRate>450m</MaxRate> <Disabled>false</Disabled> </Ascp> <Network> <KNSManager GetHTTPProxyEnabled="false"> </KNSManager> <UserAgent>windows64 sra-toolkit test-sra.3.1 (phid=noc8175...
注意:如果安装了Aspera,prefetch会优先用ascp协议下载 2018-10-16T01:43:06 prefetch.2.9.2: Downloading via fasp... 而SRA文件会默认下载在~/ncbi/public/sra 目录下 prefetch命令下载多个SRA文件: 1. 从NCBI网站下载SRA accession no.的列表文件 比如,这是一个Bioproject的相关信息页面: https://trace.ncbi....
5请问一下prefetch下载的问题sratoolkit 2.10.5和aspera 3.9.1都安装好了，但是用prefetch SRRxxx 没...
我一直使用conda安装sratools来配置prefetch ,使用源代码安装ascp 这种组合方式来尝试,并且都是使用的最新版 其中prefetch最新版本是2.10.0,ascp的最新版本是3.9.6 保持ascp不变,首先改变一下prefetch的版本 conda install sra-tools=2.9.6 -y # 目前sra-tools有12个版本,这里降一个版本 image 好,然后再次进行数...
prefetch --ascp-path "/home/HWP/.aspera/connect/bin/ascp|/home/HWP/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file SRR_Acc_List2.txt 注意: 另一个ascp的密钥文件(有时putty可能不能使用,这时可选用asperaweb_id_dsa.openssh) ...