PredictProtein是一个蛋白质结构和功能预测工具，可以预测蛋白质的二级结构，域结构，跨膜区域，表面异构体和配体结合位点等信息。预测结果是一个包含许多不同信息的报告。以下是对其中一些主要模块的解释：1、Sequencefeatures：这一模块显示蛋白质序列上的不同特征，如氨基酸序列、保守性、分子量、等电点和...
H代表α螺旋，E代表β折叠，L代表其它无规则卷曲状态。
基于predictprotein平台的蛋白质结构预测在linux命令行终端输入profbmkapfasta预测的结果为leeeehhhhhheeeeeelllllllleeelllhhhhhhhllllllllllllllllllllllllllllllllleeelllleeeeeeeeeel其中h表示表示折叠l表示无规则卷曲可以看出该蛋白质中折叠有26个无规则卷曲有50此外predictprotein平台中还有许多与蛋白质二级结构预测相关的...
1.首先进入蛋白结构在线预测网站Predict Protein server(https:www.predictprotein.org ),网页界面清晰简洁。 2.我们根据提示将蛋白质序列输入方框中,序列可以用TXT格式打开复制到框中即可。输入完成点击“PredictProtein”,等待预测结果。 3.稍等片刻,预测结果页面出现,点击,查看结果。 4.分析结果。根据出来的预测结果图...
被称为蛋白质结构预测标准的predictprotein平台[9]就是由美国哥伦比亚大学生物信息中心整合开发的基于ubuntu/linux系统的蛋白质二级结构预测平台。而rosetta是进行大分子建模、三维结构从头预测和蛋白质相互作用与对接研究的免费软件包,并自1998年以来一直在casp(critical assessment of structure prediction)竞赛中居于领先地位...
摘要: 基于predictprotein平台,通过整合threader,ROSETTA和ZDOCK等关于大分子建模的免费软件包,构建了蛋白质结构预测虚拟机,并对不能进行同源建模的BmKAP蛋白质序列的二级结构和三维结构分别进行了初步预测.关键词: 蛋白质结构预测;ROSETTA;虚拟机 DOI: CNKI:SUN:GPRJ.0.2013-14-025 被引量: 2 ...
此外,predictprotein平台中还有许多与蛋白质二级结构预测相关的命令,如coils(识别卷曲螺旋)、conformational(识别二级结构中构型变化的氨基酸)、disulfinder(识别序列中的二硫键)、nop(识别序列中的非常规二级结构)、predictnls(识别序列中的核定位信号)、profdisis(识别蛋白质和DNA间的交联位点)、profisis(识别蛋白质与...
基于PREDICTPROTEIN平台的蛋白质结构预测,基于PREDICTPROTEIN平台的蛋白质结构预测,蛋白质,结构,预测,平台,结构预测,PREDICT,蛋白,蛋白质的,的蛋白质,的预测 君,已阅读到文档的结尾了呢~~ 立即下载相似精选,再来一篇 koimr4eqgii2.. 分享于2014-03-13 07:00...
predictprotein Docker NEW AS OF 2022-10-10:A Docker image of this repository is now available atour Rostlab Quaypredictprotein-dockerDocker image repository. That means it is no longer required to buildpredictprotein-dockermanually (i.e. usingdocker build) using this repository; although you still...
predictprotein出来的图怎么分析 只看楼主收藏回复 习惯被埋没 托儿所 1 哪位大神知道这个图怎么分析? 送TA礼物 来自Android客户端1楼2017-08-01 22:39回复 盛子阳0727 托儿所 1 这个图怎么做出来的啊?为什么我们的打不开,求大神详述啊 3楼2018-09-05 16:27 收起回复 ...