方法 于2013—2019年收集中国医学科学院皮肤病医院8例反常性痤疮皮损和4例健康对照组皮肤组织进行高通量测序,获得反常性痤疮皮损特异性表达谱,进行基因本体论(GO)分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析和基因集富集分析(GSEA)。实时荧光定量PCR(qPCR)和Western印迹法验证高通量测序结果。结果 特异性表达谱显示,与...
KEGG富集分析表明DEPs相关信号通路与补体和凝血级联反应、心肌收缩、肥厚型心肌病、扩张型心肌病、肌动蛋白细胞骨架调节、谷胱甘肽代谢、TGF-β信号通路、其他聚糖降解、氧化磷酸化和心肌细胞中的肾上腺素能信号传导有关(图5B)。 为了进一步研究XSB对HF的可能治疗靶点,构建了两个PPI网络(图5C)。一种重叠蛋白聚糖(DCN)...
Most importantly, by using Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis, we found that the expression of multiple genes and proteins was associated with PPARα, β/δ, and γ, which were altered in both the transcriptomics and proteomics profiles in the atrial tissue...
KEGG pathway analysis indicated that IVF-ET manipulation extensively over-activated PPAR signaling pathway. Immune tolerance, trophoblast invasion, syncytia formation, lipid and glucose metabolism, inflammatory response and other complex biological functions were disturbed. RT-qPCR results and proteins staining...
(4)KEGG通路分析发现:目标基因会因RRE激活PPARα通路而得到进一步的调控。同时,RRE的摄入可通过调控HMGCR和CYP7A1基因表达进而抑制肝脏胆固醇的合成和转化,并且通过下调LDLR抑制胆固醇的转运。此外,RRE处理可以加速甘油三酸酯向脂肪酸的转化。综上所述:本文揭示了RRE通过PPARα信号通路改善高脂饮食诱导的小鼠高脂血症。
摘 要利用100 μmol/L油酸对细胞进行诱导分化,通过RNA-Seq技术对分化后48,96 h的细胞进行转录组测序,对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果表明:与分化48 h时相比,分化96 h时差异表达基因数增加3 519个,差异表达基因的分...
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3A). For the selected differentially expressed mRNAs (545 + 85), KEGG pathways enrichment analysis revealed that the gene set was mainly involved in processes related to the PPAR signaling pathway and arachidonic acid metabolism (Fig. 3B). Furthermore, heat map analysis of the immune-...
KEGG pathway analysis of candidate hub genes using the R language cluster Profiler package (F), identifying the TFs related to hub genes expression (G). Full size image We used the STRING online tool to construct a PPI network of overlapping hub genes and then to find our main core genes ...
然后，通过DAVID 数据库进行《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)的基因本体(GO)和途径富集分析。最后，使用Discovery Studio 2019 Client 进行分子对接。另外，以动物实验的方法进行痛风肾建模，以痹宁汤对痛风肾小鼠进行治疗，并采集样本进行分析。将其结果以转录组学方法进行测序实验分析，并作出表达量差异分析。结果：...