纳米孔RNA直接测序技术分析polyA尾不需进行PCR，流程如图5所示，将3’端接头连接至mRNA（含polyA），逆转录（可选操作）后连接至3’端测序接头（与动力蛋白连接），随后被加载到纳米孔形成的流动池，施加电压后，在动力蛋白驱动下，RNA由3’端至5’端通过纳米孔，根据特异性电流信号分辨碱基序列。
PolyA法转录组测序数据分析报告模板
PolyA法转录组测序数据分析报告模板.pdf,项目编号:GZRB201XXXXXXXXXXSSQ 客户:XXX 版本编号:RNA 测序分析报告 (polyA )-V1 修订日期:2016.12 目录 一、项目流程4 1.1 实验流程 4 1.2 信息分析流程 5 二、标准信息分析 6 2.1 参考基因组比对与全基因组 Reads 分布图谱
全长转录组应用系列一:可变polyA检测 全长转录组(Iso-Seq)是指利用三代单分子实时测序技术(SMRT),无需对RNA进行打断和拼接,即可直接获得完整的全长转录本。由于该方法可以获得全长转录本,因此与二代短序列测序技术的RNA-seq对比,侧重于转录本结构的分析,能够准确识别转录本同源异构体(isoform)、可变剪切、可变polyA...
全长转录组(Iso-Seq)是指利用三代单分子实时测序技术(SMRT),无需对RNA进行打断和拼接,即可直接获得完整的全长转录本。由于该方法可以获得全长转录本,因此与二代短序列测序技术的RNA-seq对比,侧重于转录本结构的分析,能够准确识别转录本同源异构体(isoform)、可变剪切、可变polyA、融合基因、等位基因等,因此在转录本...
话说这个TAIL-seq起初就是为了研究mRNA后面的polyA有多长以及有什么分布特点而建立的,具体原理就是将总RNA在3' 连接上生物所标记的adapter,之后做逆转录等一系列建库流程,随后测序分析polyA信息的技术(图1)。 图1来源:sciencedirect.com/scien 在将TAIL-seq的数据研究一番之后,除了一些正常的结论之外还意外的发现了...
最后,可以对富集的PolyA RNA进行下游实验,如逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)或RNA测序等。 第二种方法是利用磁珠的亲和性。在这种方法中,磁珠表面修饰有特定的亲和配体,如oligo(dT)或亲和标签。RNA样品与修饰的磁珠进行孵育,使PolyA RNA与磁珠上的亲和配体结合。然后,通过磁力分离的方法将富集的PolyA RNA与其他RNA分子...
真核生物mRNA的5'm7G Cap结构是介导各种生物学功能必需的元件,例如,核输出、剪接、RNA稳定性和高效翻译等。在细胞质中,5'm7G Cap结构是真核翻译起始因子EIF4E的锚定位点,对于起始蛋白翻译是至关重要的。5'm7G Cap结构还能保护mRNA免受5'-3'核酸外切酶的降解。体外制备mRNA时,我们可以使用两种不同的加帽方式:酶...
US2020325532A1 POLYA TAIL LENGTH ANALYSIS OF RNA BY MASS SPECTROMETRY Salles et al., PCR Methods Appl. 4: 317-321 (1995); Meijer et al., Nucleic Acids Res. 35: e132 (2007); Murray & Schoenberg, Methods EnzymoL 448: 483-504 (2008); Janicke et al., RNA 18: 1289-1295 (2012); ...