最近的研究报道,poly(A)尾巴不都是腺苷序列,还有尿苷序列,而且尿苷化会降低mRNA的稳定性,而混合加尾则倾向于提高mRNA的稳定性(Chang et al., Molecular Cell 2014; Lim et al., Science 2018)。 案例介绍 该技术在拟南芥的poly(A)加尾调控项目的研究中得到应用,揭示了拟南芥poly(A)尾介导的全新转录后调控机制...
②基于二代或三代测序技术表征polyA，已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。2018年诺华公司Beverly M等发表在Anal Bioanal Chem杂志的一篇文章，《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》，研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾，使用液相色...
②基于二代或三代测序技术表征polyA,已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。 2018年诺华公司Beverly M等发表在Anal Bioanal Chem杂志的一篇文章,《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》,研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾,使用液相色谱...
②基于二代或三代测序技术表征polyA,已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。 2018年诺华公司Beverly M等发表在Anal Bioanal Chem杂志的一篇文章,《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》,研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾,使用液相色谱...
②基于二代或三代测序技术表征polyA,已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。 2018年诺华公司Beverly M等发表在 Anal Bioanal Chem 杂志的一篇小哥,《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》,研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾,使用液相...
②基于二代或三代测序技术表征polyA,已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。 2018年诺华公司Beverly M等发表在Anal Bioanal Chem杂志的一篇文章,《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》,研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾,使用液相色谱...
Illumina RNA-Seq的原理是通过富集mRNA(polyA富集)或去除rRNA,产生片段化的RNA序列,然后将RNA逆转录生成双链cDNA,在片段末尾加入测序接头后进行PCR扩增。cDNA分子聚集在流动池,通过DNA合成体系中的3’端封锁荧光标记的核苷酸底物读取荧光信号,从一端(单端测序)或两端(成对末端测序)进行测序。
AtPAB可以提高mRNA的翻译效率。纯Poly(A)尾的mRNA在atpab突变体中翻译效率降低更为明显。atpab突变体表现出发育异常，表明Poly(A)尾与结合蛋白介导的翻译调节机制对植物生长发育至关重要。Poly(A)-seq技术展示了二代测序与生物信息学算法结合的强大优势，揭示了植物Poly(A)尾中的G含量如何通过抑制PAB...
②基于二代或三代测序技术表征polyA,已报道的测序方法包括TAIL-seq、PAL-seq、FLAM-Seq和PAIso-Seq等。 2018年诺华公司Beverly M等发表在Anal Bioanal Chem杂志的一篇文章,《Poly A tail length analysis of in vitro transcribed mRNA by LC-MS》,研究基于RNAse T1酶切与oligo dT磁珠纯化得到polyA尾,使用液相色谱...
真核生物中,几乎每条mRNA的尾部都会带有多聚腺苷酸,即poly(A)。早期基于实验证据的假说认为,poly(A)尾与胞浆中的多聚腺苷结合蛋白(PABPC)促进翻译并阻止mRNA降解(decay),但具体机制并不清楚。最近对Poly(A)尾的作用认识更加丰富:poly(A)结合蛋白可以促进poly(A)的去除(即发生脱腺苷化,deadenylation),而当mRNA...