1、PLUMED安装包(根据你所用的MD engine,PLUMED有的版本不能patch你所用的MD engine。比如!PLUMED2.6.0是最新版,但是不支持Lammps。PLUMED2.4.7反而可以!!具体的去PLUMED官网看看); 2、BLAS和LAPACK库,直接去百度下载吧,我下面也会放链接。 3、已安装好的LAMMPS。 下载路径: PLUMED资源包 How to get PLUMED...
方法/步骤 1 在电脑上安装Plumed，这里要注意的是，plumed使用的编译工具要和Lammps使用的编译工具相同，作者使用的是mpich3. 将plumed可执行程序所在的文件夹加入系统PATH路径，以便后续步骤顺利进行。2 在Lammps的根目录下，本例中也就是lammps-11Aug17文件夹下，执行plumed-patch -p就会进入选择，选择6）Lammps。...
安装LAMMPS,嵌入PLUEMD插件 官网给的安装方式见:https://github.com/plumed/conda#install-lammps 我自己写的一个:覃衣成:PLUMED安装+patch Lammps 使用LAMMPS建模和弛豫:运行http://lammps-equilibration.in。 touch plumed.dat /Users/gareth/Plumed-tutorial/LAMMPS/lammps-5Jun19/build/lmp <http://lammps-equil...
Public development project of the LAMMPS MD software package - lammps/lib/plumed/Install.py at 9c6e88f5758ffe9f1e2c7faab1a651f27383b83f · lammps/lammps
运行PLUMED给的例子的时候(Lugano tutorial: Using PLUMED with LAMMPS),出现这个问题 message: ERROR in input to action CUSTOM with labe…阅读全文 赞同6 5 条评论 分享收藏 PLUMED安装+patch Lammps 给将来的自己看,顺便造福百姓 细致入微,给电脑小白看的,其中有些术语描述不准确,望轻...
运行"plumed patch -p"时出现了一些问题: plumed: error while loading shared libraries:libplumedKernel.so: cannot open shared object file: No such file or directory 找到一个解决方案 然后就可以选择patch啥MD engine了。但是,但是!居然没看到lammps!!! 1...
引言 个人在使用PLUMED过程中所遇到的一些问题,和解决方案小结。 着实耗费心力,伤神脱发。 运行PLUMED给的例子的时候(Lugano tutorial: Using PLUMED with LAMMPS),出现这个问题 message: ERROR in input to action CUSTOM with labe… 阅读全文 PLUMED安装+patch Lammps ...