Public development project of the LAMMPS MD software package - lammps/src/EXTRA-FIX/fix_nonaffine_displacement.cpp at 56a9192cf3245912891caf0c4d96762674867b24 · lammps/lammps
6.1. Available Packages — LAMMPS documentation 例如说笔者的编译命令是: cmake ../cmake -D PKG_MANYBODY=yes -D PKG_EXTRA-FIX=yes -D PKG_MEAM=yes -D PKG_MOLECULE=yes -D PKG_VORONOI=yes #cmake 的另一个好处就在这,可以一大堆扩展包一起编译,不过容易报错,哈哈哈,报错的话需要一个一个关闭,...
pair_coeff1*2 1*2 none fix print 每隔一段时间打印一次你要监测的变量(标量)的信息。这个命令跟thermo的作用差不多,但是可以更自由地进行字符串的编辑(可以使用$()这样的immediate variable),并且可以输出到指定文件。例如每100步打印变量a、b、c的值,以覆盖模式写到coord.txt。 fix extra all print 100 & ...
第一部分，安装 《1》首先安装所有依赖的包：sudo aptitude install mpich-bin libmpich1.0gf lib...
最后是效果对比，数据来自我的电解质溶液盒子，体系特殊，仅供参考。单位timesteps/s，均匀体系+fix ...
回到src目录下make yes-gpu yes-kspace yes-extra-fix yes-user-deepmd lammps-xxx/src/MAKE/Makefile.mpi 可根据实际情况修改,不做过多介绍 make -j 4 mpi 正常编译结束后就安装完成了。 问题1:我编译出来的Lammps运行速度不理想,GPU占用率也很低,经常显卡内存溢出。
make yes-kspace make yes-extra-fix make yes-user-deepmd You can enable any other package you want. Now build LAMMPS make mpi -j4 If everything works fine, you will end up with an executable lmp_mpi. ./lmp_mpi -h The DeePMD-kit module can be removed from the LAMMPS source code...
1 change: 0 additions & 1 deletion 1 src/EXTRA-FIX/fix_deform_pressure.cpp Original file line numberDiff line numberDiff line change @@ -114,7 +114,6 @@ FixDeformPressure::FixDeformPressure(LAMMPS *lmp, int narg, char **arg) :
fix命令是lammps中很重要的一个命令, 它包括很多子命令, 对体系施加一系列的约束条件,选择系综等等. 设定 lammps进行 6、各种计算: compute, variable. 输出选项由thermo, dump, restart命令设置. (4)Run a simulation 使用run命令开始一个分子动力学模拟; 用minimize命令来实施能量最小化(molecular statics)units...
2.17fix命令 使用语法 fix ID group-ID style args ID:fix命令的ID group-ID:该fix命令所作用的原子组的ID style:fix类型名 args:特定类型fix命令所需要的参数 使用介绍 为一组原子施加fix约束。在LAMMPS中,fix是施加在分子动力学时间步或能量最小化过程中的某种操作。可能是在时间积分的过程中更新原子的位置和...